Protein–RNA interactions for Protein: Q08438

VHS3, Phosphopantothenoylcysteine decarboxylase subunit VHS3, yeastyeast

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Length 674 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VHS3Q08438 NTE1YML059C 5040 nt6.96□□□□□ -1.3
VHS3Q08438 YOS9YDR057W 1629 nt6.96□□□□□ -1.3
VHS3Q08438 YMR034CYMR034C 1305 nt6.96□□□□□ -1.3
VHS3Q08438 NMD5YJR132W 3147 nt6.96□□□□□ -1.3
VHS3Q08438 ASN2YGR124W 1719 nt6.96□□□□□ -1.3
VHS3Q08438 ATG23YLR431C 1362 nt6.95□□□□□ -1.3
VHS3Q08438 YDL177CYDL177C 513 nt6.95□□□□□ -1.3
VHS3Q08438 SPG5YMR191W 1122 nt6.95□□□□□ -1.3
VHS3Q08438 YNR005CYNR005C 405 nt6.95□□□□□ -1.3
VHS3Q08438 HGH1YGR187C 1185 nt6.94□□□□□ -1.3
VHS3Q08438 REC107YJR021C 945 nt6.94□□□□□ -1.3
VHS3Q08438 ATP4YPL078C 735 nt6.94□□□□□ -1.3
VHS3Q08438 RPL5YPL131W 894 nt6.94□□□□□ -1.3
VHS3Q08438 HIS1YER055C 894 nt6.93□□□□□ -1.3
VHS3Q08438 BUD20YLR074C 501 nt6.93□□□□□ -1.3
VHS3Q08438 PRS4YBL068W 981 nt6.93□□□□□ -1.3
VHS3Q08438 NAF1YNL124W 1479 nt6.92□□□□□ -1.3
VHS3Q08438 CIA1YDR267C 993 nt6.92□□□□□ -1.3
VHS3Q08438 BMT5YIL096C 1011 nt6.92□□□□□ -1.3
VHS3Q08438 CHS5YLR330W 2016 nt6.92□□□□□ -1.3
VHS3Q08438 SPS22YCL048W 1392 nt6.92□□□□□ -1.3
VHS3Q08438 APE4YHR113W 1473 nt6.92□□□□□ -1.3
VHS3Q08438 BDF2YDL070W 1917 nt6.91□□□□□ -1.3
VHS3Q08438 MRPS28YDR337W 861 nt6.91□□□□□ -1.3
VHS3Q08438 HSP12YFL014W 330 nt6.91□□□□□ -1.3
VHS3Q08438 YSC83YHR017W 1158 nt6.91□□□□□ -1.3
VHS3Q08438 TRR2YHR106W 1029 nt6.91□□□□□ -1.3
VHS3Q08438 MRS3YJL133W 945 nt6.91□□□□□ -1.3
VHS3Q08438 CUE4YML101C 354 nt6.91□□□□□ -1.3
VHS3Q08438 CWC25YNL245C 540 nt6.91□□□□□ -1.3
VHS3Q08438 YPQ1YOL092W 927 nt6.91□□□□□ -1.3
VHS3Q08438 HST2YPL015C 1074 nt6.91□□□□□ -1.3
VHS3Q08438 PEX31YGR004W 1389 nt6.91□□□□□ -1.3
VHS3Q08438 FCY22YER060W-A 1593 nt6.91□□□□□ -1.3
VHS3Q08438 CTF8YHR191C 402 nt6.9□□□□□ -1.3
VHS3Q08438 YJL144WYJL144W 315 nt6.9□□□□□ -1.3
VHS3Q08438 YKR032WYKR032W 315 nt6.9□□□□□ -1.3
VHS3Q08438 RPL31BYLR406C 342 nt6.9□□□□□ -1.3
VHS3Q08438 AVO2YMR068W 1281 nt6.9□□□□□ -1.3
VHS3Q08438 CLN1YMR199W 1641 nt6.9□□□□□ -1.31
VHS3Q08438 YPR150WYPR150W 522 nt6.89□□□□□ -1.31
VHS3Q08438 YCL049CYCL049C 939 nt6.89□□□□□ -1.31
VHS3Q08438 RGT2YDL138W 2292 nt6.88□□□□□ -1.31
VHS3Q08438 ECM38YLR299W 1983 nt6.88□□□□□ -1.31
VHS3Q08438 NSE5YML023C 1671 nt6.88□□□□□ -1.31
VHS3Q08438 CMR1YDL156W 1569 nt6.88□□□□□ -1.31
VHS3Q08438 CBR1YIL043C 855 nt6.88□□□□□ -1.31
VHS3Q08438 REV7YIL139C 738 nt6.88□□□□□ -1.31
VHS3Q08438 HMS2YJR147W 1077 nt6.88□□□□□ -1.31
VHS3Q08438 ICE2YIL090W 1476 nt6.87□□□□□ -1.31
VHS3Q08438 YFL052WYFL052W 1398 nt6.87□□□□□ -1.31
VHS3Q08438 EDC2YER035W 438 nt6.87□□□□□ -1.31
VHS3Q08438 YJL107CYJL107C 1164 nt6.87□□□□□ -1.31
VHS3Q08438 IRC11YOR013W 471 nt6.87□□□□□ -1.31
VHS3Q08438 NAT5YOR253W 531 nt6.87□□□□□ -1.31
VHS3Q08438 snR30snR30 606 nt6.87□□□□□ -1.31
VHS3Q08438 UME1YPL139C 1383 nt6.86□□□□□ -1.31
VHS3Q08438 YNR068CYNR068C 819 nt6.86□□□□□ -1.31
VHS3Q08438 TMA46YOR091W 1038 nt6.86□□□□□ -1.31
VHS3Q08438 CST26YBR042C 1194 nt6.86□□□□□ -1.31
VHS3Q08438 ERG10YPL028W 1197 nt6.86□□□□□ -1.31
VHS3Q08438 COA2YPL189C-A 207 nt6.86□□□□□ -1.31
VHS3Q08438 SKY1YMR216C 2229 nt6.86□□□□□ -1.31
VHS3Q08438 ENP1YBR247C 1452 nt6.85□□□□□ -1.31
VHS3Q08438 YHR020WYHR020W 2067 nt6.85□□□□□ -1.31
VHS3Q08438 TFC6YDR362C 2019 nt6.85□□□□□ -1.31
VHS3Q08438 YDR415CYDR415C 1125 nt6.85□□□□□ -1.31
VHS3Q08438 YGL102CYGL102C 429 nt6.85□□□□□ -1.31
VHS3Q08438 DYS1YHR068W 1164 nt6.85□□□□□ -1.31
VHS3Q08438 YHR140WYHR140W 720 nt6.85□□□□□ -1.31
VHS3Q08438 PRI1YIR008C 1230 nt6.85□□□□□ -1.31
VHS3Q08438 TIF2YJL138C 1188 nt6.85□□□□□ -1.31
VHS3Q08438 TPK1YJL164C 1194 nt6.85□□□□□ -1.31
VHS3Q08438 KAE1YKR038C 1161 nt6.85□□□□□ -1.31
VHS3Q08438 TIF1YKR059W 1188 nt6.85□□□□□ -1.31
VHS3Q08438 MBF1YOR298C-A 456 nt6.85□□□□□ -1.31
VHS3Q08438 SMX3YPR182W 261 nt6.85□□□□□ -1.31
VHS3Q08438 ADH5YBR145W 1056 nt6.85□□□□□ -1.31
VHS3Q08438 SEM1YDR363W-A 270 nt6.84□□□□□ -1.31
VHS3Q08438 PIC2YER053C 903 nt6.84□□□□□ -1.31
VHS3Q08438 PDA1YER178W 1263 nt6.84□□□□□ -1.31
VHS3Q08438 YJR107WYJR107W 987 nt6.84□□□□□ -1.31
VHS3Q08438 YML079WYML079W 606 nt6.84□□□□□ -1.31
VHS3Q08438 TOS6YNL300W 309 nt6.84□□□□□ -1.31
VHS3Q08438 PPM2YOL141W 2088 nt6.84□□□□□ -1.31
VHS3Q08438 MIP1YOR330C 3765 nt6.84□□□□□ -1.32
VHS3Q08438 SUF5tG(CCC)O 72 nt6.83□□□□□ -1.32
VHS3Q08438 YGL118CYGL118C 438 nt6.83□□□□□ -1.32
VHS3Q08438 YLL058WYLL058W 1728 nt6.83□□□□□ -1.32
VHS3Q08438 ECM30YLR436C 3825 nt6.83□□□□□ -1.32
VHS3Q08438 RSM23YGL129C 1353 nt6.82□□□□□ -1.32
VHS3Q08438 RRP1YDR087C 837 nt6.82□□□□□ -1.32
VHS3Q08438 ARP10YDR106W 855 nt6.82□□□□□ -1.32
VHS3Q08438 tG(GCC)BtG(GCC)B 71 nt6.82□□□□□ -1.32
VHS3Q08438 SUF16tG(GCC)C 71 nt6.82□□□□□ -1.32
VHS3Q08438 tG(GCC)D1tG(GCC)D1 71 nt6.82□□□□□ -1.32
VHS3Q08438 tG(GCC)D2tG(GCC)D2 71 nt6.82□□□□□ -1.32
VHS3Q08438 tG(GCC)EtG(GCC)E 71 nt6.82□□□□□ -1.32
VHS3Q08438 SUF20tG(GCC)F1 71 nt6.82□□□□□ -1.32
VHS3Q08438 tG(GCC)F2tG(GCC)F2 71 nt6.82□□□□□ -1.32
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