Protein–RNA interactions for Protein: P62745

RHOB, Rho-related GTP-binding protein RhoB, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOBP62745 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RHOBP62745 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RHOBP62745 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RHOBP62745 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RHOBP62745 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RHOBP62745 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RHOBP62745 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RHOBP62745 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RHOBP62745 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RHOBP62745 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
RHOBP62745 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RHOBP62745 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RHOBP62745 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RHOBP62745 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RHOBP62745 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RHOBP62745 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RHOBP62745 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RHOBP62745 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RHOBP62745 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RHOBP62745 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RHOBP62745 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RHOBP62745 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RHOBP62745 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RHOBP62745 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RHOBP62745 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RHOBP62745 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
RHOBP62745 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RHOBP62745 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RHOBP62745 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RHOBP62745 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RHOBP62745 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RHOBP62745 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RHOBP62745 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RHOBP62745 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RHOBP62745 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RHOBP62745 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
RHOBP62745 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RHOBP62745 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RHOBP62745 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RHOBP62745 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RHOBP62745 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RHOBP62745 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RHOBP62745 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RHOBP62745 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RHOBP62745 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RHOBP62745 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
RHOBP62745 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RHOBP62745 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RHOBP62745 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RHOBP62745 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RHOBP62745 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RHOBP62745 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RHOBP62745 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RHOBP62745 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RHOBP62745 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RHOBP62745 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RHOBP62745 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RHOBP62745 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RHOBP62745 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RHOBP62745 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RHOBP62745 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RHOBP62745 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
RHOBP62745 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RHOBP62745 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RHOBP62745 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RHOBP62745 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RHOBP62745 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
RHOBP62745 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RHOBP62745 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RHOBP62745 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
RHOBP62745 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RHOBP62745 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RHOBP62745 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RHOBP62745 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RHOBP62745 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RHOBP62745 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RHOBP62745 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RHOBP62745 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
RHOBP62745 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RHOBP62745 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RHOBP62745 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RHOBP62745 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RHOBP62745 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RHOBP62745 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RHOBP62745 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RHOBP62745 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
RHOBP62745 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RHOBP62745 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RHOBP62745 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RHOBP62745 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RHOBP62745 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RHOBP62745 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RHOBP62745 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RHOBP62745 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RHOBP62745 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RHOBP62745 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RHOBP62745 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RHOBP62745 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RHOBP62745 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RHOBP62745 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms