Protein–RNA interactions for Protein: P61201

COPS2, COP9 signalosome complex subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS2P61201 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
COPS2P61201 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
COPS2P61201 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
COPS2P61201 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
COPS2P61201 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
COPS2P61201 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
COPS2P61201 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
COPS2P61201 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
COPS2P61201 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
COPS2P61201 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
COPS2P61201 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
COPS2P61201 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
COPS2P61201 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
COPS2P61201 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
COPS2P61201 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
COPS2P61201 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
COPS2P61201 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
COPS2P61201 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
COPS2P61201 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
COPS2P61201 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
COPS2P61201 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
COPS2P61201 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
COPS2P61201 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
COPS2P61201 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
COPS2P61201 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
COPS2P61201 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
COPS2P61201 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
COPS2P61201 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
COPS2P61201 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
COPS2P61201 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
COPS2P61201 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
COPS2P61201 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
COPS2P61201 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
COPS2P61201 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
COPS2P61201 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
COPS2P61201 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
COPS2P61201 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
COPS2P61201 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
COPS2P61201 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
COPS2P61201 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
COPS2P61201 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
COPS2P61201 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
COPS2P61201 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
COPS2P61201 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
COPS2P61201 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
COPS2P61201 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
COPS2P61201 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
COPS2P61201 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
COPS2P61201 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
COPS2P61201 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
COPS2P61201 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
COPS2P61201 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
COPS2P61201 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
COPS2P61201 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
COPS2P61201 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
COPS2P61201 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
COPS2P61201 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
COPS2P61201 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
COPS2P61201 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
COPS2P61201 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
COPS2P61201 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
COPS2P61201 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
COPS2P61201 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
COPS2P61201 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
COPS2P61201 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
COPS2P61201 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
COPS2P61201 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
COPS2P61201 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
COPS2P61201 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
COPS2P61201 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
COPS2P61201 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
COPS2P61201 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
COPS2P61201 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
COPS2P61201 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
COPS2P61201 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
COPS2P61201 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
COPS2P61201 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
COPS2P61201 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
COPS2P61201 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
COPS2P61201 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
COPS2P61201 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
COPS2P61201 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
COPS2P61201 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
COPS2P61201 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
COPS2P61201 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
COPS2P61201 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
COPS2P61201 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
COPS2P61201 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
COPS2P61201 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
COPS2P61201 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
COPS2P61201 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
COPS2P61201 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
COPS2P61201 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
COPS2P61201 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
COPS2P61201 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
COPS2P61201 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
COPS2P61201 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
COPS2P61201 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
COPS2P61201 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
COPS2P61201 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms