Protein–RNA interactions for Protein: P61073

CXCR4, C-X-C chemokine receptor type 4, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCR4P61073 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CXCR4P61073 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CXCR4P61073 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CXCR4P61073 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CXCR4P61073 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CXCR4P61073 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CXCR4P61073 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CXCR4P61073 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CXCR4P61073 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CXCR4P61073 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CXCR4P61073 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CXCR4P61073 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CXCR4P61073 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CXCR4P61073 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CXCR4P61073 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CXCR4P61073 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CXCR4P61073 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CXCR4P61073 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CXCR4P61073 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CXCR4P61073 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CXCR4P61073 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CXCR4P61073 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CXCR4P61073 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CXCR4P61073 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CXCR4P61073 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CXCR4P61073 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CXCR4P61073 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CXCR4P61073 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CXCR4P61073 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CXCR4P61073 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CXCR4P61073 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CXCR4P61073 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CXCR4P61073 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CXCR4P61073 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CXCR4P61073 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CXCR4P61073 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CXCR4P61073 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CXCR4P61073 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CXCR4P61073 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CXCR4P61073 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CXCR4P61073 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CXCR4P61073 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CXCR4P61073 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CXCR4P61073 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CXCR4P61073 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CXCR4P61073 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CXCR4P61073 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CXCR4P61073 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CXCR4P61073 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CXCR4P61073 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CXCR4P61073 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CXCR4P61073 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CXCR4P61073 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CXCR4P61073 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CXCR4P61073 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CXCR4P61073 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CXCR4P61073 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CXCR4P61073 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CXCR4P61073 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CXCR4P61073 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CXCR4P61073 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CXCR4P61073 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CXCR4P61073 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CXCR4P61073 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CXCR4P61073 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CXCR4P61073 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CXCR4P61073 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CXCR4P61073 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CXCR4P61073 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CXCR4P61073 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CXCR4P61073 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CXCR4P61073 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CXCR4P61073 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CXCR4P61073 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CXCR4P61073 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CXCR4P61073 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CXCR4P61073 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CXCR4P61073 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CXCR4P61073 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CXCR4P61073 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CXCR4P61073 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CXCR4P61073 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CXCR4P61073 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CXCR4P61073 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CXCR4P61073 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CXCR4P61073 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CXCR4P61073 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CXCR4P61073 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CXCR4P61073 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CXCR4P61073 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CXCR4P61073 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CXCR4P61073 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CXCR4P61073 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CXCR4P61073 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CXCR4P61073 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CXCR4P61073 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CXCR4P61073 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CXCR4P61073 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CXCR4P61073 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CXCR4P61073 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms