Protein–RNA interactions for Protein: P59046

NLRP12, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 1,061 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP12P59046 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
NLRP12P59046 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NLRP12P59046 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
NLRP12P59046 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
NLRP12P59046 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NLRP12P59046 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
NLRP12P59046 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.52■■■□□ 2
NLRP12P59046 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.52■■■□□ 2
NLRP12P59046 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NLRP12P59046 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NLRP12P59046 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NLRP12P59046 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NLRP12P59046 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NLRP12P59046 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NLRP12P59046 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NLRP12P59046 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NLRP12P59046 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NLRP12P59046 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NLRP12P59046 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NLRP12P59046 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NLRP12P59046 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NLRP12P59046 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NLRP12P59046 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NLRP12P59046 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NLRP12P59046 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NLRP12P59046 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
NLRP12P59046 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NLRP12P59046 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
NLRP12P59046 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NLRP12P59046 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NLRP12P59046 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NLRP12P59046 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NLRP12P59046 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NLRP12P59046 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NLRP12P59046 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NLRP12P59046 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NLRP12P59046 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NLRP12P59046 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NLRP12P59046 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NLRP12P59046 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NLRP12P59046 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NLRP12P59046 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
NLRP12P59046 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NLRP12P59046 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NLRP12P59046 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NLRP12P59046 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NLRP12P59046 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NLRP12P59046 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NLRP12P59046 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NLRP12P59046 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NLRP12P59046 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NLRP12P59046 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NLRP12P59046 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
NLRP12P59046 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
NLRP12P59046 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NLRP12P59046 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NLRP12P59046 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NLRP12P59046 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
NLRP12P59046 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NLRP12P59046 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NLRP12P59046 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NLRP12P59046 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NLRP12P59046 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NLRP12P59046 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NLRP12P59046 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NLRP12P59046 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
NLRP12P59046 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NLRP12P59046 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NLRP12P59046 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NLRP12P59046 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NLRP12P59046 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NLRP12P59046 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NLRP12P59046 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NLRP12P59046 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
NLRP12P59046 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
NLRP12P59046 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
NLRP12P59046 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NLRP12P59046 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NLRP12P59046 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NLRP12P59046 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
NLRP12P59046 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NLRP12P59046 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
NLRP12P59046 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NLRP12P59046 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NLRP12P59046 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NLRP12P59046 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NLRP12P59046 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NLRP12P59046 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NLRP12P59046 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NLRP12P59046 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NLRP12P59046 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
NLRP12P59046 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
NLRP12P59046 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
NLRP12P59046 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
NLRP12P59046 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
NLRP12P59046 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
NLRP12P59046 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
NLRP12P59046 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
NLRP12P59046 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
NLRP12P59046 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms