Protein–RNA interactions for Protein: P55084

HADHB, Trifunctional enzyme subunit beta, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HADHBP55084 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
HADHBP55084 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
HADHBP55084 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
HADHBP55084 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
HADHBP55084 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
HADHBP55084 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
HADHBP55084 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
HADHBP55084 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
HADHBP55084 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HADHBP55084 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HADHBP55084 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HADHBP55084 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HADHBP55084 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
HADHBP55084 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HADHBP55084 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
HADHBP55084 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HADHBP55084 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
HADHBP55084 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
HADHBP55084 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HADHBP55084 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HADHBP55084 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.8■■□□□ 1.72
HADHBP55084 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
HADHBP55084 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HADHBP55084 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HADHBP55084 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HADHBP55084 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HADHBP55084 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HADHBP55084 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HADHBP55084 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
HADHBP55084 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
HADHBP55084 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
HADHBP55084 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
HADHBP55084 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HADHBP55084 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HADHBP55084 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HADHBP55084 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HADHBP55084 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HADHBP55084 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HADHBP55084 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HADHBP55084 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HADHBP55084 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
HADHBP55084 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
HADHBP55084 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
HADHBP55084 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HADHBP55084 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HADHBP55084 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HADHBP55084 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
HADHBP55084 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
HADHBP55084 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
HADHBP55084 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HADHBP55084 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HADHBP55084 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HADHBP55084 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HADHBP55084 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HADHBP55084 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HADHBP55084 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HADHBP55084 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HADHBP55084 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HADHBP55084 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HADHBP55084 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HADHBP55084 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
HADHBP55084 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HADHBP55084 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
HADHBP55084 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HADHBP55084 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HADHBP55084 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HADHBP55084 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HADHBP55084 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HADHBP55084 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HADHBP55084 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HADHBP55084 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HADHBP55084 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HADHBP55084 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HADHBP55084 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HADHBP55084 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HADHBP55084 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HADHBP55084 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
HADHBP55084 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
HADHBP55084 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
HADHBP55084 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
HADHBP55084 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HADHBP55084 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
HADHBP55084 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HADHBP55084 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
HADHBP55084 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
HADHBP55084 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HADHBP55084 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
HADHBP55084 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
HADHBP55084 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
HADHBP55084 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
HADHBP55084 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HADHBP55084 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
HADHBP55084 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HADHBP55084 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HADHBP55084 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
HADHBP55084 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HADHBP55084 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HADHBP55084 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
HADHBP55084 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
HADHBP55084 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.7 ms