Protein–RNA interactions for Protein: P52306

RAP1GDS1, Rap1 GTPase-GDP dissociation stimulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAP1GDS1P52306 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAP1GDS1P52306 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAP1GDS1P52306 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAP1GDS1P52306 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAP1GDS1P52306 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAP1GDS1P52306 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RAP1GDS1P52306 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RAP1GDS1P52306 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RAP1GDS1P52306 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RAP1GDS1P52306 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RAP1GDS1P52306 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAP1GDS1P52306 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAP1GDS1P52306 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAP1GDS1P52306 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAP1GDS1P52306 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAP1GDS1P52306 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAP1GDS1P52306 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAP1GDS1P52306 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAP1GDS1P52306 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAP1GDS1P52306 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
RAP1GDS1P52306 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RAP1GDS1P52306 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RAP1GDS1P52306 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RAP1GDS1P52306 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
RAP1GDS1P52306 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RAP1GDS1P52306 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
RAP1GDS1P52306 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
RAP1GDS1P52306 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RAP1GDS1P52306 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RAP1GDS1P52306 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAP1GDS1P52306 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAP1GDS1P52306 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAP1GDS1P52306 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAP1GDS1P52306 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAP1GDS1P52306 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAP1GDS1P52306 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAP1GDS1P52306 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
RAP1GDS1P52306 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
RAP1GDS1P52306 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
RAP1GDS1P52306 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAP1GDS1P52306 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAP1GDS1P52306 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAP1GDS1P52306 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAP1GDS1P52306 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAP1GDS1P52306 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAP1GDS1P52306 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAP1GDS1P52306 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAP1GDS1P52306 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
RAP1GDS1P52306 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
RAP1GDS1P52306 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
RAP1GDS1P52306 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
RAP1GDS1P52306 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
RAP1GDS1P52306 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
RAP1GDS1P52306 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
RAP1GDS1P52306 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
RAP1GDS1P52306 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
RAP1GDS1P52306 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAP1GDS1P52306 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAP1GDS1P52306 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAP1GDS1P52306 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAP1GDS1P52306 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAP1GDS1P52306 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAP1GDS1P52306 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAP1GDS1P52306 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAP1GDS1P52306 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAP1GDS1P52306 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAP1GDS1P52306 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAP1GDS1P52306 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAP1GDS1P52306 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAP1GDS1P52306 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAP1GDS1P52306 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAP1GDS1P52306 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAP1GDS1P52306 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAP1GDS1P52306 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAP1GDS1P52306 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RAP1GDS1P52306 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
RAP1GDS1P52306 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RAP1GDS1P52306 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RAP1GDS1P52306 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RAP1GDS1P52306 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RAP1GDS1P52306 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RAP1GDS1P52306 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RAP1GDS1P52306 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RAP1GDS1P52306 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RAP1GDS1P52306 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RAP1GDS1P52306 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RAP1GDS1P52306 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RAP1GDS1P52306 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RAP1GDS1P52306 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RAP1GDS1P52306 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RAP1GDS1P52306 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RAP1GDS1P52306 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RAP1GDS1P52306 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RAP1GDS1P52306 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RAP1GDS1P52306 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RAP1GDS1P52306 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RAP1GDS1P52306 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RAP1GDS1P52306 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RAP1GDS1P52306 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RAP1GDS1P52306 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms