Protein–RNA interactions for Protein: P49759

CLK1, Dual specificity protein kinase CLK1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK1P49759 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLK1P49759 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLK1P49759 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLK1P49759 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLK1P49759 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CLK1P49759 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLK1P49759 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLK1P49759 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLK1P49759 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLK1P49759 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLK1P49759 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLK1P49759 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLK1P49759 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLK1P49759 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLK1P49759 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLK1P49759 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLK1P49759 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLK1P49759 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLK1P49759 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLK1P49759 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CLK1P49759 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CLK1P49759 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLK1P49759 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLK1P49759 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLK1P49759 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLK1P49759 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLK1P49759 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLK1P49759 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLK1P49759 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLK1P49759 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLK1P49759 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLK1P49759 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLK1P49759 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLK1P49759 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLK1P49759 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CLK1P49759 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLK1P49759 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLK1P49759 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CLK1P49759 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CLK1P49759 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLK1P49759 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLK1P49759 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLK1P49759 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLK1P49759 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLK1P49759 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLK1P49759 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLK1P49759 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLK1P49759 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLK1P49759 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLK1P49759 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLK1P49759 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLK1P49759 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLK1P49759 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLK1P49759 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLK1P49759 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLK1P49759 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLK1P49759 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLK1P49759 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLK1P49759 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLK1P49759 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLK1P49759 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLK1P49759 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLK1P49759 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLK1P49759 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLK1P49759 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLK1P49759 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLK1P49759 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLK1P49759 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CLK1P49759 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CLK1P49759 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLK1P49759 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CLK1P49759 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLK1P49759 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLK1P49759 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLK1P49759 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLK1P49759 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLK1P49759 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLK1P49759 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLK1P49759 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLK1P49759 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLK1P49759 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLK1P49759 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLK1P49759 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLK1P49759 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLK1P49759 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLK1P49759 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLK1P49759 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLK1P49759 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLK1P49759 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLK1P49759 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLK1P49759 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLK1P49759 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CLK1P49759 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLK1P49759 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLK1P49759 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLK1P49759 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLK1P49759 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLK1P49759 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLK1P49759 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLK1P49759 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms