Protein–RNA interactions for Protein: P39023

RPL3, 60S ribosomal protein L3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL3P39023 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPL3P39023 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPL3P39023 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPL3P39023 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPL3P39023 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPL3P39023 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
RPL3P39023 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPL3P39023 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPL3P39023 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPL3P39023 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPL3P39023 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPL3P39023 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPL3P39023 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPL3P39023 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPL3P39023 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPL3P39023 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPL3P39023 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPL3P39023 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPL3P39023 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPL3P39023 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPL3P39023 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPL3P39023 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPL3P39023 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPL3P39023 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPL3P39023 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPL3P39023 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPL3P39023 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPL3P39023 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPL3P39023 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPL3P39023 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPL3P39023 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPL3P39023 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPL3P39023 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPL3P39023 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
RPL3P39023 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
RPL3P39023 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPL3P39023 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPL3P39023 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPL3P39023 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPL3P39023 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPL3P39023 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RPL3P39023 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
RPL3P39023 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RPL3P39023 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RPL3P39023 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RPL3P39023 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RPL3P39023 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RPL3P39023 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RPL3P39023 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RPL3P39023 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
RPL3P39023 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
RPL3P39023 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RPL3P39023 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
RPL3P39023 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RPL3P39023 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RPL3P39023 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RPL3P39023 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RPL3P39023 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RPL3P39023 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RPL3P39023 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RPL3P39023 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RPL3P39023 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RPL3P39023 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RPL3P39023 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RPL3P39023 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RPL3P39023 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RPL3P39023 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RPL3P39023 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RPL3P39023 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
RPL3P39023 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RPL3P39023 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RPL3P39023 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RPL3P39023 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RPL3P39023 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPL3P39023 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPL3P39023 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPL3P39023 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPL3P39023 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
RPL3P39023 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
RPL3P39023 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPL3P39023 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPL3P39023 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPL3P39023 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPL3P39023 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPL3P39023 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPL3P39023 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPL3P39023 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
RPL3P39023 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPL3P39023 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPL3P39023 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPL3P39023 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPL3P39023 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPL3P39023 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPL3P39023 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPL3P39023 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPL3P39023 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPL3P39023 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPL3P39023 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RPL3P39023 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RPL3P39023 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.5 ms