Protein–RNA interactions for Protein: P36954

POLR2I, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2IP36954 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
POLR2IP36954 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
POLR2IP36954 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
POLR2IP36954 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
POLR2IP36954 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
POLR2IP36954 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
POLR2IP36954 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
POLR2IP36954 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
POLR2IP36954 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
POLR2IP36954 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
POLR2IP36954 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
POLR2IP36954 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
POLR2IP36954 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
POLR2IP36954 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
POLR2IP36954 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
POLR2IP36954 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
POLR2IP36954 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
POLR2IP36954 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
POLR2IP36954 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
POLR2IP36954 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLR2IP36954 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLR2IP36954 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLR2IP36954 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLR2IP36954 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLR2IP36954 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
POLR2IP36954 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
POLR2IP36954 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
POLR2IP36954 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
POLR2IP36954 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
POLR2IP36954 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
POLR2IP36954 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
POLR2IP36954 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
POLR2IP36954 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
POLR2IP36954 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
POLR2IP36954 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
POLR2IP36954 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
POLR2IP36954 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
POLR2IP36954 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
POLR2IP36954 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
POLR2IP36954 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
POLR2IP36954 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
POLR2IP36954 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
POLR2IP36954 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
POLR2IP36954 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
POLR2IP36954 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
POLR2IP36954 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
POLR2IP36954 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
POLR2IP36954 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
POLR2IP36954 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
POLR2IP36954 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
POLR2IP36954 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
POLR2IP36954 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
POLR2IP36954 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
POLR2IP36954 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
POLR2IP36954 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
POLR2IP36954 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
POLR2IP36954 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
POLR2IP36954 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
POLR2IP36954 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
POLR2IP36954 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
POLR2IP36954 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
POLR2IP36954 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
POLR2IP36954 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
POLR2IP36954 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
POLR2IP36954 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
POLR2IP36954 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
POLR2IP36954 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
POLR2IP36954 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
POLR2IP36954 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
POLR2IP36954 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
POLR2IP36954 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
POLR2IP36954 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
POLR2IP36954 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
POLR2IP36954 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
POLR2IP36954 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
POLR2IP36954 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
POLR2IP36954 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
POLR2IP36954 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
POLR2IP36954 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
POLR2IP36954 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
POLR2IP36954 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
POLR2IP36954 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
POLR2IP36954 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
POLR2IP36954 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
POLR2IP36954 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
POLR2IP36954 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
POLR2IP36954 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
POLR2IP36954 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
POLR2IP36954 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLR2IP36954 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLR2IP36954 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLR2IP36954 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLR2IP36954 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLR2IP36954 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLR2IP36954 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLR2IP36954 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLR2IP36954 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
POLR2IP36954 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLR2IP36954 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
POLR2IP36954 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.8 ms