Protein–RNA interactions for Protein: P32340

NDI1, Rotenone-insensitive NADH-ubiquinone oxidoreductase, mitochondrial, yeastyeast

Predictions only

Length 513 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NDI1P32340 YKL077WYKL077W 1179 nt6.72□□□□□ -1.33
NDI1P32340 MEU1YLR017W 1014 nt6.72□□□□□ -1.33
NDI1P32340 COQ1YBR003W 1422 nt6.72□□□□□ -1.33
NDI1P32340 YEN1YER041W 2280 nt6.71□□□□□ -1.33
NDI1P32340 DOT1YDR440W 1749 nt6.71□□□□□ -1.34
NDI1P32340 PPH22YDL188C 1134 nt6.71□□□□□ -1.34
NDI1P32340 RPL2BYIL018W 765 nt6.71□□□□□ -1.34
NDI1P32340 GCN3YKR026C 918 nt6.71□□□□□ -1.34
NDI1P32340 IRC11YOR013W 471 nt6.71□□□□□ -1.34
NDI1P32340 COX10YPL172C 1389 nt6.7□□□□□ -1.34
NDI1P32340 ATG22YCL038C 1587 nt6.7□□□□□ -1.34
NDI1P32340 MRPL35YDR322W 1104 nt6.7□□□□□ -1.34
NDI1P32340 LCL3YGL085W 825 nt6.7□□□□□ -1.34
NDI1P32340 COX16YJL003W 357 nt6.7□□□□□ -1.34
NDI1P32340 YOR111WYOR111W 699 nt6.7□□□□□ -1.34
NDI1P32340 CIR2YOR356W 1896 nt6.69□□□□□ -1.34
NDI1P32340 ATG36YJL185C 882 nt6.69□□□□□ -1.34
NDI1P32340 TAF9YMR236W 474 nt6.69□□□□□ -1.34
NDI1P32340 LSC1YOR142W 990 nt6.69□□□□□ -1.34
NDI1P32340 YHK8YHR048W 1545 nt6.69□□□□□ -1.34
NDI1P32340 tG(GCC)BtG(GCC)B 71 nt6.68□□□□□ -1.34
NDI1P32340 SUF16tG(GCC)C 71 nt6.68□□□□□ -1.34
NDI1P32340 tG(GCC)D1tG(GCC)D1 71 nt6.68□□□□□ -1.34
NDI1P32340 tG(GCC)D2tG(GCC)D2 71 nt6.68□□□□□ -1.34
NDI1P32340 tG(GCC)EtG(GCC)E 71 nt6.68□□□□□ -1.34
NDI1P32340 SUF20tG(GCC)F1 71 nt6.68□□□□□ -1.34
NDI1P32340 tG(GCC)F2tG(GCC)F2 71 nt6.68□□□□□ -1.34
NDI1P32340 tG(GCC)G1tG(GCC)G1 71 nt6.68□□□□□ -1.34
NDI1P32340 tG(GCC)G2tG(GCC)G2 71 nt6.68□□□□□ -1.34
NDI1P32340 tG(GCC)J1tG(GCC)J1 71 nt6.68□□□□□ -1.34
NDI1P32340 SUF23tG(GCC)J2 71 nt6.68□□□□□ -1.34
NDI1P32340 tG(GCC)MtG(GCC)M 71 nt6.68□□□□□ -1.34
NDI1P32340 tG(GCC)O1tG(GCC)O1 71 nt6.68□□□□□ -1.34
NDI1P32340 SUF17tG(GCC)O2 71 nt6.68□□□□□ -1.34
NDI1P32340 tG(GCC)P1tG(GCC)P1 71 nt6.68□□□□□ -1.34
NDI1P32340 tG(GCC)P2tG(GCC)P2 71 nt6.68□□□□□ -1.34
NDI1P32340 HIS1YER055C 894 nt6.68□□□□□ -1.34
NDI1P32340 IDP3YNL009W 1263 nt6.68□□□□□ -1.34
NDI1P32340 MRPS18YNL306W 654 nt6.68□□□□□ -1.34
NDI1P32340 ACO1YLR304C 2337 nt6.68□□□□□ -1.34
NDI1P32340 VTS1YOR359W 1572 nt6.68□□□□□ -1.34
NDI1P32340 TOS2YGR221C 1869 nt6.68□□□□□ -1.34
NDI1P32340 RBS1YDL189W 1374 nt6.68□□□□□ -1.34
NDI1P32340 YKL102CYKL102C 306 nt6.67□□□□□ -1.34
NDI1P32340 DFR1YOR236W 636 nt6.67□□□□□ -1.34
NDI1P32340 STT3YGL022W 2157 nt6.67□□□□□ -1.34
NDI1P32340 YLL066CYLL066C 3618 nt6.67□□□□□ -1.34
NDI1P32340 MIP1YOR330C 3765 nt6.66□□□□□ -1.34
NDI1P32340 YRB2YIL063C 984 nt6.66□□□□□ -1.34
NDI1P32340 RFC4YOL094C 972 nt6.66□□□□□ -1.34
NDI1P32340 MRPL23YOR150W 492 nt6.66□□□□□ -1.34
NDI1P32340 YIL029W-AYIL029W-A 372 nt6.65□□□□□ -1.34
NDI1P32340 MIA40YKL195W 1212 nt6.65□□□□□ -1.34
NDI1P32340 YNL092WYNL092W 1203 nt6.65□□□□□ -1.34
NDI1P32340 SMK1YPR054W 1167 nt6.65□□□□□ -1.34
NDI1P32340 PEX31YGR004W 1389 nt6.65□□□□□ -1.35
NDI1P32340 SAL1YNL083W 1485 nt6.65□□□□□ -1.35
NDI1P32340 RSP5YER125W 2430 nt6.64□□□□□ -1.35
NDI1P32340 GCG1YER163C 699 nt6.64□□□□□ -1.35
NDI1P32340 YKR032WYKR032W 315 nt6.64□□□□□ -1.35
NDI1P32340 HSM3YBR272C 1443 nt6.64□□□□□ -1.35
NDI1P32340 YHR213W-BYHR213W-B 300 nt6.63□□□□□ -1.35
NDI1P32340 YAR064WYAR064W 300 nt6.63□□□□□ -1.35
NDI1P32340 RRN10YBL025W 438 nt6.63□□□□□ -1.35
NDI1P32340 ERG12YMR208W 1332 nt6.63□□□□□ -1.35
NDI1P32340 EDE1YBL047C 4146 nt6.63□□□□□ -1.35
NDI1P32340 FAL1YDR021W 1200 nt6.62□□□□□ -1.35
NDI1P32340 YDR415CYDR415C 1125 nt6.62□□□□□ -1.35
NDI1P32340 OM45YIL136W 1182 nt6.62□□□□□ -1.35
NDI1P32340 RPL5YPL131W 894 nt6.62□□□□□ -1.35
NDI1P32340 YPL257WYPL257W 582 nt6.62□□□□□ -1.35
NDI1P32340 OPI11YPR044C 354 nt6.62□□□□□ -1.35
NDI1P32340 OPI8YKR035C 642 nt6.61□□□□□ -1.35
NDI1P32340 CUE4YML101C 354 nt6.61□□□□□ -1.35
NDI1P32340 YPL250W-AYPL250W-A 288 nt6.61□□□□□ -1.35
NDI1P32340 YOS9YDR057W 1629 nt6.61□□□□□ -1.35
NDI1P32340 CIT3YPR001W 1461 nt6.6□□□□□ -1.35
NDI1P32340 SKY1YMR216C 2229 nt6.6□□□□□ -1.35
NDI1P32340 YJR146WYJR146W 354 nt6.6□□□□□ -1.35
NDI1P32340 KSH1YNL024C-A 219 nt6.6□□□□□ -1.35
NDI1P32340 TOS6YNL300W 309 nt6.6□□□□□ -1.35
NDI1P32340 NMD5YJR132W 3147 nt6.6□□□□□ -1.35
NDI1P32340 ASN2YGR124W 1719 nt6.59□□□□□ -1.35
NDI1P32340 ERG8YMR220W 1356 nt6.59□□□□□ -1.35
NDI1P32340 YPT1YFL038C 621 nt6.59□□□□□ -1.35
NDI1P32340 CTF19YPL018W 1110 nt6.59□□□□□ -1.35
NDI1P32340 ILV6YCL009C 930 nt6.59□□□□□ -1.35
NDI1P32340 ADE17YMR120C 1779 nt6.59□□□□□ -1.35
NDI1P32340 HEM1YDR232W 1647 nt6.58□□□□□ -1.36
NDI1P32340 IMG1YCR046C 510 nt6.58□□□□□ -1.36
NDI1P32340 YGR139WYGR139W 339 nt6.58□□□□□ -1.36
NDI1P32340 DYS1YHR068W 1164 nt6.58□□□□□ -1.36
NDI1P32340 AIM20YIL158W 615 nt6.58□□□□□ -1.36
NDI1P32340 LYS1YIR034C 1122 nt6.58□□□□□ -1.36
NDI1P32340 YJR107WYJR107W 987 nt6.58□□□□□ -1.36
NDI1P32340 RUF23RUF23 254 nt6.58□□□□□ -1.36
NDI1P32340 GFA1YKL104C 2154 nt6.58□□□□□ -1.36
NDI1P32340 PRP2YNR011C 2631 nt6.57□□□□□ -1.36
NDI1P32340 EHD3YDR036C 1503 nt6.57□□□□□ -1.36
NDI1P32340 SHO1YER118C 1104 nt6.57□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 10 ms