Protein–RNA interactions for Protein: P30536

TSPO, Translocator protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOP30536 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TSPOP30536 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TSPOP30536 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TSPOP30536 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TSPOP30536 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TSPOP30536 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TSPOP30536 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TSPOP30536 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TSPOP30536 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TSPOP30536 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TSPOP30536 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TSPOP30536 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TSPOP30536 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TSPOP30536 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TSPOP30536 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TSPOP30536 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TSPOP30536 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TSPOP30536 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TSPOP30536 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TSPOP30536 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TSPOP30536 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TSPOP30536 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TSPOP30536 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TSPOP30536 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TSPOP30536 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TSPOP30536 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TSPOP30536 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TSPOP30536 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TSPOP30536 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TSPOP30536 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TSPOP30536 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TSPOP30536 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TSPOP30536 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TSPOP30536 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TSPOP30536 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TSPOP30536 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TSPOP30536 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TSPOP30536 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TSPOP30536 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TSPOP30536 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TSPOP30536 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TSPOP30536 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TSPOP30536 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TSPOP30536 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TSPOP30536 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TSPOP30536 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TSPOP30536 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TSPOP30536 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TSPOP30536 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TSPOP30536 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TSPOP30536 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TSPOP30536 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TSPOP30536 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TSPOP30536 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TSPOP30536 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TSPOP30536 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TSPOP30536 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TSPOP30536 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TSPOP30536 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TSPOP30536 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TSPOP30536 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TSPOP30536 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TSPOP30536 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TSPOP30536 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TSPOP30536 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TSPOP30536 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TSPOP30536 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TSPOP30536 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
TSPOP30536 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
TSPOP30536 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TSPOP30536 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TSPOP30536 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
TSPOP30536 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TSPOP30536 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TSPOP30536 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TSPOP30536 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TSPOP30536 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TSPOP30536 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TSPOP30536 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TSPOP30536 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TSPOP30536 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TSPOP30536 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TSPOP30536 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TSPOP30536 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TSPOP30536 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TSPOP30536 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TSPOP30536 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TSPOP30536 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TSPOP30536 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TSPOP30536 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TSPOP30536 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TSPOP30536 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TSPOP30536 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TSPOP30536 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TSPOP30536 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TSPOP30536 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TSPOP30536 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TSPOP30536 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TSPOP30536 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TSPOP30536 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.4 ms