Protein–RNA interactions for Protein: P24723

PRKCH, Protein kinase C eta type, humanhuman

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCHP24723 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRKCHP24723 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRKCHP24723 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PRKCHP24723 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PRKCHP24723 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PRKCHP24723 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PRKCHP24723 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRKCHP24723 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRKCHP24723 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRKCHP24723 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
PRKCHP24723 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRKCHP24723 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRKCHP24723 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRKCHP24723 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRKCHP24723 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRKCHP24723 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRKCHP24723 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRKCHP24723 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRKCHP24723 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRKCHP24723 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRKCHP24723 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRKCHP24723 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRKCHP24723 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRKCHP24723 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRKCHP24723 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRKCHP24723 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRKCHP24723 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
PRKCHP24723 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRKCHP24723 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRKCHP24723 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRKCHP24723 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRKCHP24723 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRKCHP24723 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PRKCHP24723 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PRKCHP24723 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRKCHP24723 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRKCHP24723 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRKCHP24723 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRKCHP24723 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRKCHP24723 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRKCHP24723 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRKCHP24723 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRKCHP24723 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRKCHP24723 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRKCHP24723 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRKCHP24723 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRKCHP24723 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRKCHP24723 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRKCHP24723 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRKCHP24723 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRKCHP24723 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRKCHP24723 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRKCHP24723 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRKCHP24723 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRKCHP24723 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
PRKCHP24723 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRKCHP24723 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRKCHP24723 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRKCHP24723 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRKCHP24723 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRKCHP24723 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRKCHP24723 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRKCHP24723 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRKCHP24723 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRKCHP24723 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRKCHP24723 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRKCHP24723 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRKCHP24723 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRKCHP24723 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRKCHP24723 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRKCHP24723 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
PRKCHP24723 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRKCHP24723 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRKCHP24723 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRKCHP24723 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRKCHP24723 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRKCHP24723 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRKCHP24723 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
PRKCHP24723 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRKCHP24723 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRKCHP24723 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRKCHP24723 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRKCHP24723 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRKCHP24723 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRKCHP24723 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRKCHP24723 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRKCHP24723 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRKCHP24723 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRKCHP24723 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRKCHP24723 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRKCHP24723 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRKCHP24723 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRKCHP24723 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRKCHP24723 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRKCHP24723 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRKCHP24723 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRKCHP24723 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRKCHP24723 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRKCHP24723 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRKCHP24723 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69 ms