Protein–RNA interactions for Protein: P22748

CA4, Carbonic anhydrase 4, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CA4P22748 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CA4P22748 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CA4P22748 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CA4P22748 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CA4P22748 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CA4P22748 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CA4P22748 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CA4P22748 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CA4P22748 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CA4P22748 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CA4P22748 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CA4P22748 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CA4P22748 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CA4P22748 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CA4P22748 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CA4P22748 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CA4P22748 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CA4P22748 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CA4P22748 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CA4P22748 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CA4P22748 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CA4P22748 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CA4P22748 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CA4P22748 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CA4P22748 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CA4P22748 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CA4P22748 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CA4P22748 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CA4P22748 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CA4P22748 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CA4P22748 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CA4P22748 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CA4P22748 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CA4P22748 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CA4P22748 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CA4P22748 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CA4P22748 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CA4P22748 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CA4P22748 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CA4P22748 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CA4P22748 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CA4P22748 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CA4P22748 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CA4P22748 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CA4P22748 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CA4P22748 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CA4P22748 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CA4P22748 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CA4P22748 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CA4P22748 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CA4P22748 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CA4P22748 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CA4P22748 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CA4P22748 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CA4P22748 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CA4P22748 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CA4P22748 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CA4P22748 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CA4P22748 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CA4P22748 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CA4P22748 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CA4P22748 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CA4P22748 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CA4P22748 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CA4P22748 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CA4P22748 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CA4P22748 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
CA4P22748 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CA4P22748 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CA4P22748 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CA4P22748 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CA4P22748 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CA4P22748 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CA4P22748 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CA4P22748 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CA4P22748 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CA4P22748 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CA4P22748 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CA4P22748 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CA4P22748 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CA4P22748 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CA4P22748 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
CA4P22748 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CA4P22748 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CA4P22748 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CA4P22748 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CA4P22748 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CA4P22748 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CA4P22748 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CA4P22748 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CA4P22748 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CA4P22748 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CA4P22748 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CA4P22748 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CA4P22748 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CA4P22748 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CA4P22748 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CA4P22748 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CA4P22748 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CA4P22748 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms