Protein–RNA interactions for Protein: P22736

NR4A1, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR4A1P22736 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NR4A1P22736 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NR4A1P22736 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NR4A1P22736 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
NR4A1P22736 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NR4A1P22736 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NR4A1P22736 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NR4A1P22736 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NR4A1P22736 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NR4A1P22736 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NR4A1P22736 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NR4A1P22736 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NR4A1P22736 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NR4A1P22736 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NR4A1P22736 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NR4A1P22736 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NR4A1P22736 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NR4A1P22736 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NR4A1P22736 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NR4A1P22736 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NR4A1P22736 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NR4A1P22736 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NR4A1P22736 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
NR4A1P22736 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NR4A1P22736 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NR4A1P22736 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NR4A1P22736 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NR4A1P22736 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NR4A1P22736 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NR4A1P22736 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NR4A1P22736 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NR4A1P22736 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NR4A1P22736 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NR4A1P22736 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NR4A1P22736 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NR4A1P22736 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NR4A1P22736 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NR4A1P22736 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NR4A1P22736 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NR4A1P22736 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NR4A1P22736 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
NR4A1P22736 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
NR4A1P22736 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NR4A1P22736 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
NR4A1P22736 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NR4A1P22736 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NR4A1P22736 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NR4A1P22736 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NR4A1P22736 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NR4A1P22736 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NR4A1P22736 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NR4A1P22736 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NR4A1P22736 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NR4A1P22736 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NR4A1P22736 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NR4A1P22736 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NR4A1P22736 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NR4A1P22736 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NR4A1P22736 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NR4A1P22736 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NR4A1P22736 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NR4A1P22736 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NR4A1P22736 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NR4A1P22736 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NR4A1P22736 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
NR4A1P22736 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
NR4A1P22736 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NR4A1P22736 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NR4A1P22736 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NR4A1P22736 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
NR4A1P22736 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NR4A1P22736 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NR4A1P22736 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NR4A1P22736 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NR4A1P22736 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NR4A1P22736 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NR4A1P22736 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NR4A1P22736 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NR4A1P22736 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NR4A1P22736 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NR4A1P22736 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NR4A1P22736 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NR4A1P22736 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NR4A1P22736 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NR4A1P22736 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NR4A1P22736 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
NR4A1P22736 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NR4A1P22736 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NR4A1P22736 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
NR4A1P22736 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NR4A1P22736 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NR4A1P22736 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NR4A1P22736 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NR4A1P22736 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NR4A1P22736 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NR4A1P22736 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NR4A1P22736 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NR4A1P22736 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NR4A1P22736 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NR4A1P22736 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms