Protein–RNA interactions for Protein: P18564

ITGB6, Integrin beta-6, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB6P18564 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ITGB6P18564 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
ITGB6P18564 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ITGB6P18564 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ITGB6P18564 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ITGB6P18564 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ITGB6P18564 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ITGB6P18564 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ITGB6P18564 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ITGB6P18564 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ITGB6P18564 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ITGB6P18564 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ITGB6P18564 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ITGB6P18564 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
ITGB6P18564 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ITGB6P18564 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ITGB6P18564 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ITGB6P18564 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ITGB6P18564 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ITGB6P18564 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ITGB6P18564 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ITGB6P18564 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ITGB6P18564 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ITGB6P18564 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ITGB6P18564 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ITGB6P18564 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ITGB6P18564 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ITGB6P18564 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ITGB6P18564 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ITGB6P18564 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ITGB6P18564 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ITGB6P18564 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ITGB6P18564 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ITGB6P18564 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ITGB6P18564 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ITGB6P18564 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ITGB6P18564 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ITGB6P18564 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ITGB6P18564 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ITGB6P18564 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ITGB6P18564 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ITGB6P18564 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ITGB6P18564 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ITGB6P18564 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ITGB6P18564 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ITGB6P18564 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ITGB6P18564 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ITGB6P18564 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
ITGB6P18564 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ITGB6P18564 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
ITGB6P18564 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ITGB6P18564 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ITGB6P18564 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ITGB6P18564 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ITGB6P18564 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ITGB6P18564 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ITGB6P18564 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ITGB6P18564 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ITGB6P18564 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ITGB6P18564 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ITGB6P18564 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ITGB6P18564 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ITGB6P18564 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ITGB6P18564 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ITGB6P18564 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ITGB6P18564 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ITGB6P18564 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
ITGB6P18564 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ITGB6P18564 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ITGB6P18564 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ITGB6P18564 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
ITGB6P18564 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ITGB6P18564 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
ITGB6P18564 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
ITGB6P18564 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
ITGB6P18564 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ITGB6P18564 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ITGB6P18564 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ITGB6P18564 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ITGB6P18564 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ITGB6P18564 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ITGB6P18564 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ITGB6P18564 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ITGB6P18564 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ITGB6P18564 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ITGB6P18564 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ITGB6P18564 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ITGB6P18564 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ITGB6P18564 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ITGB6P18564 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ITGB6P18564 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ITGB6P18564 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ITGB6P18564 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ITGB6P18564 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ITGB6P18564 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ITGB6P18564 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ITGB6P18564 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ITGB6P18564 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
ITGB6P18564 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ITGB6P18564 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms