Protein–RNA interactions for Protein: P13073

COX4I1, Cytochrome c oxidase subunit 4 isoform 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX4I1P13073 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
COX4I1P13073 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
COX4I1P13073 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
COX4I1P13073 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
COX4I1P13073 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
COX4I1P13073 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
COX4I1P13073 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
COX4I1P13073 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
COX4I1P13073 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
COX4I1P13073 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
COX4I1P13073 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
COX4I1P13073 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
COX4I1P13073 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
COX4I1P13073 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
COX4I1P13073 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
COX4I1P13073 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
COX4I1P13073 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
COX4I1P13073 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
COX4I1P13073 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
COX4I1P13073 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
COX4I1P13073 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
COX4I1P13073 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
COX4I1P13073 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
COX4I1P13073 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
COX4I1P13073 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
COX4I1P13073 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
COX4I1P13073 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
COX4I1P13073 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
COX4I1P13073 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
COX4I1P13073 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
COX4I1P13073 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
COX4I1P13073 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
COX4I1P13073 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
COX4I1P13073 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
COX4I1P13073 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
COX4I1P13073 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
COX4I1P13073 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
COX4I1P13073 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
COX4I1P13073 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
COX4I1P13073 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
COX4I1P13073 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
COX4I1P13073 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
COX4I1P13073 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
COX4I1P13073 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
COX4I1P13073 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
COX4I1P13073 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
COX4I1P13073 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
COX4I1P13073 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
COX4I1P13073 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
COX4I1P13073 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
COX4I1P13073 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
COX4I1P13073 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
COX4I1P13073 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
COX4I1P13073 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
COX4I1P13073 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
COX4I1P13073 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
COX4I1P13073 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
COX4I1P13073 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
COX4I1P13073 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
COX4I1P13073 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
COX4I1P13073 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
COX4I1P13073 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
COX4I1P13073 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
COX4I1P13073 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
COX4I1P13073 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
COX4I1P13073 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
COX4I1P13073 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
COX4I1P13073 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
COX4I1P13073 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
COX4I1P13073 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
COX4I1P13073 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
COX4I1P13073 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
COX4I1P13073 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
COX4I1P13073 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
COX4I1P13073 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
COX4I1P13073 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
COX4I1P13073 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
COX4I1P13073 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
COX4I1P13073 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
COX4I1P13073 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
COX4I1P13073 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
COX4I1P13073 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
COX4I1P13073 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
COX4I1P13073 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
COX4I1P13073 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
COX4I1P13073 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
COX4I1P13073 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
COX4I1P13073 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
COX4I1P13073 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
COX4I1P13073 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
COX4I1P13073 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
COX4I1P13073 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
COX4I1P13073 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
COX4I1P13073 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
COX4I1P13073 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
COX4I1P13073 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
COX4I1P13073 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
COX4I1P13073 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
COX4I1P13073 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
COX4I1P13073 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 141.3 ms