Protein–RNA interactions for Protein: P12694

BCKDHA, 2-oxoisovalerate dehydrogenase subunit alpha, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCKDHAP12694 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BCKDHAP12694 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BCKDHAP12694 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
BCKDHAP12694 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
BCKDHAP12694 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
BCKDHAP12694 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BCKDHAP12694 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BCKDHAP12694 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BCKDHAP12694 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BCKDHAP12694 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BCKDHAP12694 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BCKDHAP12694 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BCKDHAP12694 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BCKDHAP12694 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BCKDHAP12694 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
BCKDHAP12694 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BCKDHAP12694 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BCKDHAP12694 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BCKDHAP12694 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
BCKDHAP12694 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BCKDHAP12694 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BCKDHAP12694 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BCKDHAP12694 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BCKDHAP12694 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BCKDHAP12694 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BCKDHAP12694 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BCKDHAP12694 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BCKDHAP12694 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BCKDHAP12694 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BCKDHAP12694 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
BCKDHAP12694 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BCKDHAP12694 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BCKDHAP12694 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BCKDHAP12694 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BCKDHAP12694 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BCKDHAP12694 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
BCKDHAP12694 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BCKDHAP12694 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BCKDHAP12694 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BCKDHAP12694 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BCKDHAP12694 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BCKDHAP12694 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BCKDHAP12694 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
BCKDHAP12694 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
BCKDHAP12694 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
BCKDHAP12694 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BCKDHAP12694 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BCKDHAP12694 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BCKDHAP12694 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BCKDHAP12694 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BCKDHAP12694 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BCKDHAP12694 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BCKDHAP12694 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
BCKDHAP12694 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BCKDHAP12694 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BCKDHAP12694 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BCKDHAP12694 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BCKDHAP12694 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BCKDHAP12694 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BCKDHAP12694 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BCKDHAP12694 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BCKDHAP12694 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BCKDHAP12694 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BCKDHAP12694 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BCKDHAP12694 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
BCKDHAP12694 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
BCKDHAP12694 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
BCKDHAP12694 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BCKDHAP12694 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BCKDHAP12694 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BCKDHAP12694 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BCKDHAP12694 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BCKDHAP12694 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BCKDHAP12694 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BCKDHAP12694 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BCKDHAP12694 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BCKDHAP12694 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BCKDHAP12694 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BCKDHAP12694 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BCKDHAP12694 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BCKDHAP12694 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
BCKDHAP12694 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
BCKDHAP12694 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BCKDHAP12694 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BCKDHAP12694 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BCKDHAP12694 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BCKDHAP12694 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BCKDHAP12694 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BCKDHAP12694 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BCKDHAP12694 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
BCKDHAP12694 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BCKDHAP12694 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
BCKDHAP12694 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BCKDHAP12694 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
BCKDHAP12694 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
BCKDHAP12694 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BCKDHAP12694 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
BCKDHAP12694 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BCKDHAP12694 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
BCKDHAP12694 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 132.2 ms