Protein–RNA interactions for Protein: P10828

THRB, Thyroid hormone receptor beta, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THRBP10828 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
THRBP10828 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
THRBP10828 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
THRBP10828 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
THRBP10828 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
THRBP10828 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
THRBP10828 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
THRBP10828 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
THRBP10828 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
THRBP10828 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
THRBP10828 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
THRBP10828 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
THRBP10828 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
THRBP10828 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
THRBP10828 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
THRBP10828 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
THRBP10828 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
THRBP10828 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
THRBP10828 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
THRBP10828 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
THRBP10828 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
THRBP10828 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
THRBP10828 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
THRBP10828 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
THRBP10828 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
THRBP10828 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
THRBP10828 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
THRBP10828 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
THRBP10828 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
THRBP10828 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
THRBP10828 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
THRBP10828 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
THRBP10828 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
THRBP10828 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
THRBP10828 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
THRBP10828 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
THRBP10828 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
THRBP10828 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
THRBP10828 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
THRBP10828 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
THRBP10828 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
THRBP10828 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
THRBP10828 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
THRBP10828 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
THRBP10828 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
THRBP10828 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
THRBP10828 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
THRBP10828 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
THRBP10828 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
THRBP10828 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
THRBP10828 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
THRBP10828 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
THRBP10828 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
THRBP10828 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
THRBP10828 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
THRBP10828 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
THRBP10828 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
THRBP10828 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
THRBP10828 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
THRBP10828 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
THRBP10828 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
THRBP10828 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
THRBP10828 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
THRBP10828 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
THRBP10828 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
THRBP10828 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
THRBP10828 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
THRBP10828 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
THRBP10828 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
THRBP10828 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
THRBP10828 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
THRBP10828 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
THRBP10828 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
THRBP10828 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
THRBP10828 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
THRBP10828 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
THRBP10828 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
THRBP10828 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
THRBP10828 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
THRBP10828 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
THRBP10828 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
THRBP10828 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
THRBP10828 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
THRBP10828 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
THRBP10828 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
THRBP10828 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
THRBP10828 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
THRBP10828 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
THRBP10828 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
THRBP10828 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
THRBP10828 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
THRBP10828 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
THRBP10828 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
THRBP10828 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
THRBP10828 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
THRBP10828 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
THRBP10828 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
THRBP10828 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
THRBP10828 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
THRBP10828 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms