Protein–RNA interactions for Protein: P0C7W0

PRR29, Proline-rich protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRR29P0C7W0 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PRR29P0C7W0 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PRR29P0C7W0 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PRR29P0C7W0 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PRR29P0C7W0 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PRR29P0C7W0 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
PRR29P0C7W0 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
PRR29P0C7W0 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
PRR29P0C7W0 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PRR29P0C7W0 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PRR29P0C7W0 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PRR29P0C7W0 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PRR29P0C7W0 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PRR29P0C7W0 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PRR29P0C7W0 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PRR29P0C7W0 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PRR29P0C7W0 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PRR29P0C7W0 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PRR29P0C7W0 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PRR29P0C7W0 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
PRR29P0C7W0 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PRR29P0C7W0 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PRR29P0C7W0 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PRR29P0C7W0 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PRR29P0C7W0 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PRR29P0C7W0 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
PRR29P0C7W0 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PRR29P0C7W0 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PRR29P0C7W0 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PRR29P0C7W0 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PRR29P0C7W0 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PRR29P0C7W0 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PRR29P0C7W0 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PRR29P0C7W0 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
PRR29P0C7W0 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
PRR29P0C7W0 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PRR29P0C7W0 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PRR29P0C7W0 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
PRR29P0C7W0 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PRR29P0C7W0 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PRR29P0C7W0 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PRR29P0C7W0 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PRR29P0C7W0 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PRR29P0C7W0 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PRR29P0C7W0 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PRR29P0C7W0 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PRR29P0C7W0 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PRR29P0C7W0 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PRR29P0C7W0 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PRR29P0C7W0 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PRR29P0C7W0 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PRR29P0C7W0 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PRR29P0C7W0 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PRR29P0C7W0 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PRR29P0C7W0 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PRR29P0C7W0 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PRR29P0C7W0 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PRR29P0C7W0 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PRR29P0C7W0 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
PRR29P0C7W0 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PRR29P0C7W0 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PRR29P0C7W0 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PRR29P0C7W0 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PRR29P0C7W0 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PRR29P0C7W0 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PRR29P0C7W0 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PRR29P0C7W0 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PRR29P0C7W0 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PRR29P0C7W0 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
PRR29P0C7W0 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PRR29P0C7W0 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PRR29P0C7W0 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PRR29P0C7W0 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PRR29P0C7W0 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PRR29P0C7W0 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PRR29P0C7W0 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PRR29P0C7W0 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PRR29P0C7W0 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PRR29P0C7W0 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PRR29P0C7W0 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
PRR29P0C7W0 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PRR29P0C7W0 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PRR29P0C7W0 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PRR29P0C7W0 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PRR29P0C7W0 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PRR29P0C7W0 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PRR29P0C7W0 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PRR29P0C7W0 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PRR29P0C7W0 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PRR29P0C7W0 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PRR29P0C7W0 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PRR29P0C7W0 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PRR29P0C7W0 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PRR29P0C7W0 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PRR29P0C7W0 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
PRR29P0C7W0 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PRR29P0C7W0 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
PRR29P0C7W0 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PRR29P0C7W0 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PRR29P0C7W0 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms