Protein–RNA interactions for Protein: P07437

TUBB, Tubulin beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBBP07437 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TUBBP07437 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TUBBP07437 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TUBBP07437 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
TUBBP07437 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TUBBP07437 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TUBBP07437 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TUBBP07437 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TUBBP07437 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TUBBP07437 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TUBBP07437 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TUBBP07437 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TUBBP07437 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TUBBP07437 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TUBBP07437 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
TUBBP07437 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TUBBP07437 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TUBBP07437 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TUBBP07437 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TUBBP07437 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TUBBP07437 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TUBBP07437 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TUBBP07437 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TUBBP07437 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TUBBP07437 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TUBBP07437 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TUBBP07437 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TUBBP07437 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TUBBP07437 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TUBBP07437 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TUBBP07437 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TUBBP07437 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
TUBBP07437 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TUBBP07437 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TUBBP07437 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TUBBP07437 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TUBBP07437 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TUBBP07437 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
TUBBP07437 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TUBBP07437 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TUBBP07437 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TUBBP07437 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TUBBP07437 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TUBBP07437 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TUBBP07437 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TUBBP07437 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TUBBP07437 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TUBBP07437 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TUBBP07437 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TUBBP07437 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TUBBP07437 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TUBBP07437 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TUBBP07437 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TUBBP07437 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TUBBP07437 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TUBBP07437 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TUBBP07437 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TUBBP07437 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TUBBP07437 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TUBBP07437 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TUBBP07437 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TUBBP07437 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TUBBP07437 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TUBBP07437 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TUBBP07437 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TUBBP07437 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TUBBP07437 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TUBBP07437 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TUBBP07437 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TUBBP07437 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TUBBP07437 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
TUBBP07437 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TUBBP07437 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TUBBP07437 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TUBBP07437 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TUBBP07437 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TUBBP07437 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
TUBBP07437 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TUBBP07437 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TUBBP07437 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TUBBP07437 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TUBBP07437 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TUBBP07437 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TUBBP07437 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TUBBP07437 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TUBBP07437 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TUBBP07437 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TUBBP07437 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TUBBP07437 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TUBBP07437 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TUBBP07437 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TUBBP07437 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TUBBP07437 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TUBBP07437 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TUBBP07437 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TUBBP07437 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TUBBP07437 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TUBBP07437 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TUBBP07437 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TUBBP07437 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.4 ms