Protein–RNA interactions for Protein: P05976

MYL1, Myosin light chain 1/3, skeletal muscle isoform, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYL1P05976 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
MYL1P05976 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
MYL1P05976 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
MYL1P05976 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
MYL1P05976 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
MYL1P05976 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
MYL1P05976 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
MYL1P05976 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
MYL1P05976 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
MYL1P05976 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
MYL1P05976 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
MYL1P05976 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
MYL1P05976 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
MYL1P05976 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
MYL1P05976 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
MYL1P05976 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
MYL1P05976 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
MYL1P05976 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
MYL1P05976 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
MYL1P05976 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
MYL1P05976 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
MYL1P05976 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
MYL1P05976 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
MYL1P05976 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
MYL1P05976 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
MYL1P05976 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
MYL1P05976 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
MYL1P05976 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
MYL1P05976 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
MYL1P05976 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
MYL1P05976 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
MYL1P05976 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
MYL1P05976 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
MYL1P05976 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
MYL1P05976 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
MYL1P05976 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
MYL1P05976 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
MYL1P05976 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
MYL1P05976 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
MYL1P05976 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
MYL1P05976 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
MYL1P05976 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
MYL1P05976 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
MYL1P05976 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
MYL1P05976 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
MYL1P05976 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
MYL1P05976 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
MYL1P05976 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
MYL1P05976 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
MYL1P05976 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
MYL1P05976 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
MYL1P05976 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
MYL1P05976 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
MYL1P05976 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
MYL1P05976 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
MYL1P05976 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
MYL1P05976 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
MYL1P05976 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
MYL1P05976 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
MYL1P05976 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
MYL1P05976 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
MYL1P05976 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
MYL1P05976 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
MYL1P05976 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
MYL1P05976 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
MYL1P05976 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
MYL1P05976 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
MYL1P05976 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
MYL1P05976 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
MYL1P05976 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
MYL1P05976 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
MYL1P05976 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
MYL1P05976 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
MYL1P05976 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
MYL1P05976 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
MYL1P05976 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
MYL1P05976 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
MYL1P05976 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
MYL1P05976 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
MYL1P05976 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
MYL1P05976 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
MYL1P05976 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
MYL1P05976 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
MYL1P05976 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
MYL1P05976 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
MYL1P05976 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
MYL1P05976 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
MYL1P05976 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
MYL1P05976 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
MYL1P05976 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
MYL1P05976 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
MYL1P05976 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
MYL1P05976 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
MYL1P05976 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
MYL1P05976 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
MYL1P05976 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
MYL1P05976 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
MYL1P05976 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
MYL1P05976 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
MYL1P05976 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms