Protein–RNA interactions for Protein: P02766

TTR, Transthyretin, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTRP02766 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TTRP02766 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TTRP02766 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TTRP02766 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TTRP02766 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TTRP02766 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TTRP02766 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TTRP02766 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TTRP02766 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TTRP02766 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TTRP02766 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TTRP02766 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TTRP02766 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TTRP02766 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TTRP02766 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TTRP02766 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TTRP02766 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TTRP02766 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TTRP02766 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TTRP02766 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TTRP02766 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TTRP02766 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TTRP02766 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TTRP02766 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TTRP02766 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TTRP02766 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TTRP02766 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TTRP02766 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TTRP02766 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TTRP02766 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TTRP02766 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC21.33■■□□□ 1
TTRP02766 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TTRP02766 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TTRP02766 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TTRP02766 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TTRP02766 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TTRP02766 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TTRP02766 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TTRP02766 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TTRP02766 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
TTRP02766 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TTRP02766 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TTRP02766 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TTRP02766 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TTRP02766 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TTRP02766 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TTRP02766 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TTRP02766 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TTRP02766 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TTRP02766 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TTRP02766 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TTRP02766 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TTRP02766 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TTRP02766 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TTRP02766 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TTRP02766 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TTRP02766 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TTRP02766 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TTRP02766 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TTRP02766 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
TTRP02766 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TTRP02766 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TTRP02766 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TTRP02766 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TTRP02766 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TTRP02766 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TTRP02766 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TTRP02766 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TTRP02766 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TTRP02766 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TTRP02766 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TTRP02766 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TTRP02766 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TTRP02766 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TTRP02766 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TTRP02766 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TTRP02766 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TTRP02766 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TTRP02766 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TTRP02766 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TTRP02766 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TTRP02766 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TTRP02766 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
TTRP02766 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TTRP02766 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TTRP02766 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TTRP02766 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TTRP02766 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TTRP02766 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TTRP02766 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TTRP02766 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TTRP02766 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TTRP02766 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TTRP02766 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TTRP02766 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TTRP02766 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TTRP02766 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TTRP02766 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TTRP02766 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TTRP02766 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms