Protein–RNA interactions for Protein: P02381

VAR1, Ribosomal protein VAR1, mitochondrial, yeast

Predictions only

Length 398 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
VAR1	P02381	YOL099C	YOL099C	492 nt		5.24	□□□□□ -1.57
VAR1	P02381	YPR130C	YPR130C	408 nt		5.24	□□□□□ -1.57
VAR1	P02381	RMD9	YGL107C	1941 nt		5.24	□□□□□ -1.57
VAR1	P02381	PLB2	YMR006C	2121 nt		5.24	□□□□□ -1.57
VAR1	P02381	YHC3	YJL059W	1227 nt		5.23	□□□□□ -1.57
VAR1	P02381	RDN5-2	RDN5-2	119 nt		5.23	□□□□□ -1.57
VAR1	P02381	RDN5-3	RDN5-3	119 nt		5.23	□□□□□ -1.57
VAR1	P02381	RDN5-4	RDN5-4	119 nt		5.23	□□□□□ -1.57
VAR1	P02381	RDN5-5	RDN5-5	119 nt		5.23	□□□□□ -1.57
VAR1	P02381	PRS4	YBL068W	981 nt		5.23	□□□□□ -1.57
VAR1	P02381	YNR014W	YNR014W	639 nt		5.23	□□□□□ -1.57
VAR1	P02381	CWC27	YPL064C	906 nt		5.23	□□□□□ -1.57
VAR1	P02381	YPL067C	YPL067C	597 nt		5.23	□□□□□ -1.57
VAR1	P02381	GEF1	YJR040W	2340 nt		5.23	□□□□□ -1.57
VAR1	P02381	YOL036W	YOL036W	2286 nt		5.22	□□□□□ -1.57
VAR1	P02381	MSS1	YMR023C	1581 nt		5.22	□□□□□ -1.57
VAR1	P02381	COX16	YJL003W	357 nt		5.22	□□□□□ -1.57
VAR1	P02381	PTH2	YBL057C	627 nt		5.22	□□□□□ -1.57
VAR1	P02381	MRP51	YPL118W	1035 nt		5.22	□□□□□ -1.57
VAR1	P02381	CRZ1	YNL027W	2037 nt		5.22	□□□□□ -1.57
VAR1	P02381	NSE5	YML023C	1671 nt		5.21	□□□□□ -1.57
VAR1	P02381	SLA2	YNL243W	2907 nt		5.21	□□□□□ -1.57
VAR1	P02381	IMA2	YOL157C	1770 nt		5.21	□□□□□ -1.58
VAR1	P02381	TKL1	YPR074C	2043 nt		5.21	□□□□□ -1.58
VAR1	P02381	YPL247C	YPL247C	1572 nt		5.21	□□□□□ -1.58
VAR1	P02381	GEX1	YCL073C	1848 nt		5.2	□□□□□ -1.58
VAR1	P02381	GEX2	YKR106W	1848 nt		5.2	□□□□□ -1.58
VAR1	P02381	TIM22	YDL217C	624 nt		5.2	□□□□□ -1.58
VAR1	P02381	CIA1	YDR267C	993 nt		5.2	□□□□□ -1.58
VAR1	P02381	HSP150	YJL159W	1242 nt		5.2	□□□□□ -1.58
VAR1	P02381	YML079W	YML079W	606 nt		5.2	□□□□□ -1.58
VAR1	P02381	YOR300W	YOR300W	309 nt		5.2	□□□□□ -1.58
VAR1	P02381	FAT3	YKL187C	2253 nt		5.2	□□□□□ -1.58
VAR1	P02381	GFA1	YKL104C	2154 nt		5.19	□□□□□ -1.58
VAR1	P02381	UME1	YPL139C	1383 nt		5.19	□□□□□ -1.58
VAR1	P02381	YDR387C	YDR387C	1668 nt		5.19	□□□□□ -1.58
VAR1	P02381	IRS4	YKR019C	1848 nt		5.19	□□□□□ -1.58
VAR1	P02381	SGV1	YPR161C	1974 nt		5.19	□□□□□ -1.58
VAR1	P02381	YNR005C	YNR005C	405 nt		5.19	□□□□□ -1.58
VAR1	P02381	YPQ1	YOL092W	927 nt		5.19	□□□□□ -1.58
VAR1	P02381	PAC2	YER007W	1557 nt		5.19	□□□□□ -1.58
VAR1	P02381	XBP1	YIL101C	1944 nt		5.19	□□□□□ -1.58
VAR1	P02381	EDC2	YER035W	438 nt		5.18	□□□□□ -1.58
VAR1	P02381	PTC7	YHR076W	1032 nt		5.18	□□□□□ -1.58
VAR1	P02381	HTZ1	YOL012C	405 nt		5.18	□□□□□ -1.58
VAR1	P02381	NTG2	YOL043C	1143 nt		5.18	□□□□□ -1.58
VAR1	P02381	PPH22	YDL188C	1134 nt		5.17	□□□□□ -1.58
VAR1	P02381	PDA1	YER178W	1263 nt		5.17	□□□□□ -1.58
VAR1	P02381	REC107	YJR021C	945 nt		5.17	□□□□□ -1.58
VAR1	P02381	GEP5	YLR091W	882 nt		5.17	□□□□□ -1.58
VAR1	P02381	CST26	YBR042C	1194 nt		5.17	□□□□□ -1.58
VAR1	P02381	ATP4	YPL078C	735 nt		5.17	□□□□□ -1.58
VAR1	P02381	YMR279C	YMR279C	1623 nt		5.16	□□□□□ -1.58
VAR1	P02381	NAF1	YNL124W	1479 nt		5.16	□□□□□ -1.58
VAR1	P02381	URH1	YDR400W	1023 nt		5.16	□□□□□ -1.58
VAR1	P02381	CYS3	YAL012W	1185 nt		5.16	□□□□□ -1.58
VAR1	P02381	YAL019W-A	YAL019W-A	570 nt		5.16	□□□□□ -1.58
VAR1	P02381	MBF1	YOR298C-A	456 nt		5.16	□□□□□ -1.58
VAR1	P02381	snR30	snR30	606 nt		5.16	□□□□□ -1.58
VAR1	P02381	GPT2	YKR067W	2232 nt		5.15	□□□□□ -1.58
VAR1	P02381	YFL013W-A	YFL013W-A	804 nt		5.15	□□□□□ -1.59
VAR1	P02381	RPL31B	YLR406C	342 nt		5.15	□□□□□ -1.59
VAR1	P02381	YCL049C	YCL049C	939 nt		5.15	□□□□□ -1.59
VAR1	P02381	GPB2	YAL056W	2643 nt		5.15	□□□□□ -1.59
VAR1	P02381	YMR034C	YMR034C	1305 nt		5.15	□□□□□ -1.59
VAR1	P02381	RGD2	YFL047W	2145 nt		5.15	□□□□□ -1.59
VAR1	P02381	ESC8	YOL017W	2145 nt		5.14	□□□□□ -1.59
VAR1	P02381	EHD3	YDR036C	1503 nt		5.14	□□□□□ -1.59
VAR1	P02381	YDL177C	YDL177C	513 nt		5.14	□□□□□ -1.59
VAR1	P02381	PPM1	YDR435C	987 nt		5.14	□□□□□ -1.59
VAR1	P02381	CBR1	YIL043C	855 nt		5.14	□□□□□ -1.59
VAR1	P02381	YLR162W	YLR162W	357 nt		5.14	□□□□□ -1.59
VAR1	P02381	SPG5	YMR191W	1122 nt		5.14	□□□□□ -1.59
VAR1	P02381	RPL5	YPL131W	894 nt		5.14	□□□□□ -1.59
VAR1	P02381	SCT1	YBL011W	2280 nt		5.14	□□□□□ -1.59
VAR1	P02381	ARG81	YML099C	2643 nt		5.14	□□□□□ -1.59
VAR1	P02381	TRS31	YDR472W	852 nt		5.13	□□□□□ -1.59
VAR1	P02381	YGL102C	YGL102C	429 nt		5.13	□□□□□ -1.59
VAR1	P02381	PUP2	YGR253C	783 nt		5.13	□□□□□ -1.59
VAR1	P02381	CIS3	YJL158C	684 nt		5.13	□□□□□ -1.59
VAR1	P02381	ASN1	YPR145W	1719 nt		5.13	□□□□□ -1.59
VAR1	P02381	RNR3	YIL066C	2610 nt		5.13	□□□□□ -1.59
VAR1	P02381	ALT1	YLR089C	1779 nt		5.13	□□□□□ -1.59
VAR1	P02381	APE4	YHR113W	1473 nt		5.13	□□□□□ -1.59
VAR1	P02381	SMX3	YPR182W	261 nt		5.12	□□□□□ -1.59
VAR1	P02381	MIP1	YOR330C	3765 nt		5.11	□□□□□ -1.59
VAR1	P02381	MRPS28	YDR337W	861 nt		5.11	□□□□□ -1.59
VAR1	P02381	SPG1	YGR236C	288 nt		5.11	□□□□□ -1.59
VAR1	P02381	GCN3	YKR026C	918 nt		5.11	□□□□□ -1.59
VAR1	P02381	RHO4	YKR055W	876 nt		5.11	□□□□□ -1.59
VAR1	P02381	AIM33	YML087C	939 nt		5.11	□□□□□ -1.59
VAR1	P02381	MRPL19	YNL185C	477 nt		5.11	□□□□□ -1.59
VAR1	P02381	IMA5	YJL216C	1746 nt		5.11	□□□□□ -1.59
VAR1	P02381	FLC3	YGL139W	2409 nt		5.1	□□□□□ -1.59
VAR1	P02381	PEX31	YGR004W	1389 nt		5.1	□□□□□ -1.59
VAR1	P02381	YSC83	YHR017W	1158 nt		5.1	□□□□□ -1.59
VAR1	P02381	AIM46	YHR199C	933 nt		5.1	□□□□□ -1.59
VAR1	P02381	YJL144W	YJL144W	315 nt		5.1	□□□□□ -1.59
VAR1	P02381	YLL056C	YLL056C	897 nt		5.1	□□□□□ -1.59
VAR1	P02381	PEX13	YLR191W	1161 nt		5.1	□□□□□ -1.59

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