Protein–RNA interactions for Protein: O75365

PTP4A3, Protein tyrosine phosphatase type IVA 3, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A3O75365 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTP4A3O75365 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTP4A3O75365 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTP4A3O75365 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTP4A3O75365 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTP4A3O75365 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTP4A3O75365 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTP4A3O75365 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PTP4A3O75365 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PTP4A3O75365 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PTP4A3O75365 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTP4A3O75365 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTP4A3O75365 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTP4A3O75365 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTP4A3O75365 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTP4A3O75365 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTP4A3O75365 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTP4A3O75365 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTP4A3O75365 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTP4A3O75365 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTP4A3O75365 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTP4A3O75365 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTP4A3O75365 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTP4A3O75365 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PTP4A3O75365 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTP4A3O75365 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTP4A3O75365 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTP4A3O75365 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PTP4A3O75365 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTP4A3O75365 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTP4A3O75365 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTP4A3O75365 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTP4A3O75365 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTP4A3O75365 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTP4A3O75365 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTP4A3O75365 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTP4A3O75365 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTP4A3O75365 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PTP4A3O75365 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PTP4A3O75365 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTP4A3O75365 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTP4A3O75365 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTP4A3O75365 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTP4A3O75365 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTP4A3O75365 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTP4A3O75365 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTP4A3O75365 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTP4A3O75365 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTP4A3O75365 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTP4A3O75365 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTP4A3O75365 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTP4A3O75365 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTP4A3O75365 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTP4A3O75365 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PTP4A3O75365 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTP4A3O75365 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTP4A3O75365 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTP4A3O75365 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTP4A3O75365 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PTP4A3O75365 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTP4A3O75365 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTP4A3O75365 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTP4A3O75365 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTP4A3O75365 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTP4A3O75365 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTP4A3O75365 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTP4A3O75365 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTP4A3O75365 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PTP4A3O75365 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTP4A3O75365 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTP4A3O75365 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PTP4A3O75365 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTP4A3O75365 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTP4A3O75365 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTP4A3O75365 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTP4A3O75365 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTP4A3O75365 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTP4A3O75365 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTP4A3O75365 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTP4A3O75365 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTP4A3O75365 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PTP4A3O75365 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTP4A3O75365 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTP4A3O75365 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTP4A3O75365 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTP4A3O75365 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTP4A3O75365 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTP4A3O75365 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTP4A3O75365 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PTP4A3O75365 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTP4A3O75365 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PTP4A3O75365 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTP4A3O75365 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PTP4A3O75365 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTP4A3O75365 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTP4A3O75365 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTP4A3O75365 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTP4A3O75365 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTP4A3O75365 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTP4A3O75365 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms