Protein–RNA interactions for Protein: O43896

KIF1C, Kinesin-like protein KIF1C, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF1CO43896 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KIF1CO43896 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KIF1CO43896 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KIF1CO43896 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KIF1CO43896 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KIF1CO43896 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KIF1CO43896 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KIF1CO43896 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
KIF1CO43896 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KIF1CO43896 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KIF1CO43896 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KIF1CO43896 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KIF1CO43896 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
KIF1CO43896 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KIF1CO43896 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KIF1CO43896 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
KIF1CO43896 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
KIF1CO43896 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KIF1CO43896 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KIF1CO43896 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KIF1CO43896 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KIF1CO43896 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KIF1CO43896 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KIF1CO43896 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KIF1CO43896 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KIF1CO43896 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KIF1CO43896 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KIF1CO43896 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KIF1CO43896 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KIF1CO43896 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KIF1CO43896 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KIF1CO43896 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KIF1CO43896 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KIF1CO43896 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KIF1CO43896 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KIF1CO43896 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KIF1CO43896 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KIF1CO43896 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KIF1CO43896 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KIF1CO43896 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KIF1CO43896 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KIF1CO43896 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KIF1CO43896 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
KIF1CO43896 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KIF1CO43896 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KIF1CO43896 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
KIF1CO43896 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KIF1CO43896 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KIF1CO43896 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KIF1CO43896 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KIF1CO43896 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KIF1CO43896 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KIF1CO43896 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KIF1CO43896 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KIF1CO43896 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KIF1CO43896 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KIF1CO43896 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KIF1CO43896 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KIF1CO43896 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KIF1CO43896 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KIF1CO43896 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KIF1CO43896 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KIF1CO43896 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KIF1CO43896 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KIF1CO43896 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KIF1CO43896 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KIF1CO43896 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KIF1CO43896 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KIF1CO43896 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KIF1CO43896 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
KIF1CO43896 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KIF1CO43896 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
KIF1CO43896 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KIF1CO43896 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KIF1CO43896 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KIF1CO43896 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KIF1CO43896 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KIF1CO43896 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
KIF1CO43896 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
KIF1CO43896 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
KIF1CO43896 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
KIF1CO43896 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KIF1CO43896 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KIF1CO43896 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
KIF1CO43896 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
KIF1CO43896 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KIF1CO43896 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KIF1CO43896 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KIF1CO43896 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KIF1CO43896 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KIF1CO43896 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
KIF1CO43896 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KIF1CO43896 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KIF1CO43896 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KIF1CO43896 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KIF1CO43896 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KIF1CO43896 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KIF1CO43896 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KIF1CO43896 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KIF1CO43896 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms