Protein–RNA interactions for Protein: O43772

SLC25A20, Mitochondrial carnitine/acylcarnitine carrier protein, humanhuman

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A20O43772 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC25A20O43772 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC25A20O43772 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC25A20O43772 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC25A20O43772 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC25A20O43772 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC25A20O43772 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC25A20O43772 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC25A20O43772 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC25A20O43772 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC25A20O43772 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC25A20O43772 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC25A20O43772 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC25A20O43772 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC25A20O43772 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC25A20O43772 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC25A20O43772 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC25A20O43772 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC25A20O43772 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC25A20O43772 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC25A20O43772 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC25A20O43772 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC25A20O43772 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC25A20O43772 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC25A20O43772 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC25A20O43772 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC25A20O43772 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC25A20O43772 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC25A20O43772 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC25A20O43772 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC25A20O43772 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC25A20O43772 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC25A20O43772 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC25A20O43772 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC25A20O43772 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC25A20O43772 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC25A20O43772 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC25A20O43772 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC25A20O43772 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC25A20O43772 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC25A20O43772 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC25A20O43772 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC25A20O43772 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC25A20O43772 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC25A20O43772 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC25A20O43772 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC25A20O43772 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC25A20O43772 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC25A20O43772 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC25A20O43772 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC25A20O43772 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC25A20O43772 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC25A20O43772 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC25A20O43772 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC25A20O43772 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC25A20O43772 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC25A20O43772 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC25A20O43772 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC25A20O43772 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC25A20O43772 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC25A20O43772 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC25A20O43772 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC25A20O43772 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC25A20O43772 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC25A20O43772 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC25A20O43772 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC25A20O43772 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC25A20O43772 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC25A20O43772 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC25A20O43772 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC25A20O43772 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC25A20O43772 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC25A20O43772 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC25A20O43772 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC25A20O43772 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC25A20O43772 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC25A20O43772 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC25A20O43772 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC25A20O43772 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC25A20O43772 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC25A20O43772 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC25A20O43772 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC25A20O43772 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC25A20O43772 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC25A20O43772 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC25A20O43772 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC25A20O43772 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC25A20O43772 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC25A20O43772 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC25A20O43772 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC25A20O43772 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC25A20O43772 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC25A20O43772 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC25A20O43772 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC25A20O43772 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC25A20O43772 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC25A20O43772 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC25A20O43772 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC25A20O43772 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC25A20O43772 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms