Protein–RNA interactions for Protein: O43707

ACTN4, Alpha-actinin-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN4O43707 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ACTN4O43707 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ACTN4O43707 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ACTN4O43707 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ACTN4O43707 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ACTN4O43707 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ACTN4O43707 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ACTN4O43707 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ACTN4O43707 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ACTN4O43707 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ACTN4O43707 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ACTN4O43707 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ACTN4O43707 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ACTN4O43707 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ACTN4O43707 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ACTN4O43707 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
ACTN4O43707 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ACTN4O43707 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ACTN4O43707 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ACTN4O43707 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
ACTN4O43707 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
ACTN4O43707 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
ACTN4O43707 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ACTN4O43707 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
ACTN4O43707 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
ACTN4O43707 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ACTN4O43707 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
ACTN4O43707 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ACTN4O43707 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ACTN4O43707 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ACTN4O43707 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ACTN4O43707 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
ACTN4O43707 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ACTN4O43707 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
ACTN4O43707 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
ACTN4O43707 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
ACTN4O43707 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ACTN4O43707 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.53■■■□□ 2
ACTN4O43707 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ACTN4O43707 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ACTN4O43707 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ACTN4O43707 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ACTN4O43707 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ACTN4O43707 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
ACTN4O43707 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
ACTN4O43707 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ACTN4O43707 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
ACTN4O43707 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
ACTN4O43707 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
ACTN4O43707 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ACTN4O43707 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ACTN4O43707 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ACTN4O43707 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
ACTN4O43707 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ACTN4O43707 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
ACTN4O43707 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ACTN4O43707 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ACTN4O43707 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ACTN4O43707 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ACTN4O43707 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ACTN4O43707 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ACTN4O43707 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ACTN4O43707 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ACTN4O43707 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ACTN4O43707 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ACTN4O43707 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ACTN4O43707 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ACTN4O43707 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ACTN4O43707 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
ACTN4O43707 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ACTN4O43707 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
ACTN4O43707 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ACTN4O43707 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ACTN4O43707 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ACTN4O43707 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ACTN4O43707 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ACTN4O43707 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ACTN4O43707 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ACTN4O43707 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ACTN4O43707 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ACTN4O43707 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ACTN4O43707 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
ACTN4O43707 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ACTN4O43707 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ACTN4O43707 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ACTN4O43707 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
ACTN4O43707 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
ACTN4O43707 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
ACTN4O43707 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
ACTN4O43707 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ACTN4O43707 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ACTN4O43707 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ACTN4O43707 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ACTN4O43707 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ACTN4O43707 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ACTN4O43707 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ACTN4O43707 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ACTN4O43707 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ACTN4O43707 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ACTN4O43707 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms