Protein–RNA interactions for Protein: O43424

GRID2, Glutamate receptor ionotropic, delta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,007 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRID2O43424 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GRID2O43424 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
GRID2O43424 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GRID2O43424 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GRID2O43424 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GRID2O43424 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GRID2O43424 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GRID2O43424 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GRID2O43424 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GRID2O43424 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GRID2O43424 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GRID2O43424 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GRID2O43424 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GRID2O43424 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GRID2O43424 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GRID2O43424 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GRID2O43424 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GRID2O43424 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GRID2O43424 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GRID2O43424 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GRID2O43424 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GRID2O43424 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GRID2O43424 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
GRID2O43424 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
GRID2O43424 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GRID2O43424 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GRID2O43424 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GRID2O43424 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GRID2O43424 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GRID2O43424 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GRID2O43424 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GRID2O43424 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GRID2O43424 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GRID2O43424 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
GRID2O43424 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GRID2O43424 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
GRID2O43424 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GRID2O43424 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GRID2O43424 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GRID2O43424 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GRID2O43424 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GRID2O43424 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GRID2O43424 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GRID2O43424 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GRID2O43424 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
GRID2O43424 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GRID2O43424 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GRID2O43424 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GRID2O43424 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GRID2O43424 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GRID2O43424 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GRID2O43424 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GRID2O43424 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GRID2O43424 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GRID2O43424 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GRID2O43424 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GRID2O43424 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GRID2O43424 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GRID2O43424 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GRID2O43424 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GRID2O43424 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
GRID2O43424 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GRID2O43424 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GRID2O43424 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GRID2O43424 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GRID2O43424 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GRID2O43424 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GRID2O43424 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GRID2O43424 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GRID2O43424 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GRID2O43424 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GRID2O43424 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GRID2O43424 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GRID2O43424 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GRID2O43424 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GRID2O43424 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GRID2O43424 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
GRID2O43424 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
GRID2O43424 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GRID2O43424 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GRID2O43424 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GRID2O43424 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GRID2O43424 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GRID2O43424 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GRID2O43424 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GRID2O43424 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GRID2O43424 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GRID2O43424 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
GRID2O43424 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GRID2O43424 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GRID2O43424 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GRID2O43424 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GRID2O43424 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GRID2O43424 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GRID2O43424 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GRID2O43424 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GRID2O43424 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GRID2O43424 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GRID2O43424 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GRID2O43424 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms