Protein–RNA interactions for Protein: O15145

ARPC3, Actin-related protein 2/3 complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARPC3O15145 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARPC3O15145 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARPC3O15145 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARPC3O15145 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARPC3O15145 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARPC3O15145 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARPC3O15145 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARPC3O15145 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARPC3O15145 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARPC3O15145 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARPC3O15145 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARPC3O15145 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARPC3O15145 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARPC3O15145 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ARPC3O15145 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARPC3O15145 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARPC3O15145 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ARPC3O15145 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ARPC3O15145 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ARPC3O15145 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ARPC3O15145 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ARPC3O15145 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ARPC3O15145 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ARPC3O15145 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ARPC3O15145 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ARPC3O15145 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ARPC3O15145 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ARPC3O15145 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ARPC3O15145 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ARPC3O15145 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ARPC3O15145 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ARPC3O15145 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ARPC3O15145 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ARPC3O15145 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ARPC3O15145 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ARPC3O15145 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ARPC3O15145 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ARPC3O15145 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ARPC3O15145 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ARPC3O15145 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ARPC3O15145 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ARPC3O15145 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ARPC3O15145 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
ARPC3O15145 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ARPC3O15145 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ARPC3O15145 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ARPC3O15145 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ARPC3O15145 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ARPC3O15145 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ARPC3O15145 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ARPC3O15145 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ARPC3O15145 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ARPC3O15145 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ARPC3O15145 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ARPC3O15145 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ARPC3O15145 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
ARPC3O15145 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ARPC3O15145 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ARPC3O15145 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ARPC3O15145 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ARPC3O15145 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ARPC3O15145 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
ARPC3O15145 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ARPC3O15145 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ARPC3O15145 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ARPC3O15145 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ARPC3O15145 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ARPC3O15145 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ARPC3O15145 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ARPC3O15145 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ARPC3O15145 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ARPC3O15145 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ARPC3O15145 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ARPC3O15145 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ARPC3O15145 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ARPC3O15145 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ARPC3O15145 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ARPC3O15145 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ARPC3O15145 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ARPC3O15145 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ARPC3O15145 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ARPC3O15145 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ARPC3O15145 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ARPC3O15145 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
ARPC3O15145 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ARPC3O15145 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ARPC3O15145 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ARPC3O15145 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ARPC3O15145 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ARPC3O15145 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
ARPC3O15145 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ARPC3O15145 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ARPC3O15145 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ARPC3O15145 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ARPC3O15145 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ARPC3O15145 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ARPC3O15145 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ARPC3O15145 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ARPC3O15145 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ARPC3O15145 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms