Protein–RNA interactions for Protein: H3BN98

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BN98 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
H3BN98 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
H3BN98 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
H3BN98 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
H3BN98 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
H3BN98 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
H3BN98 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
H3BN98 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
H3BN98 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
H3BN98 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
H3BN98 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
H3BN98 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
H3BN98 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
H3BN98 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
H3BN98 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
H3BN98 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
H3BN98 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
H3BN98 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
H3BN98 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
H3BN98 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
H3BN98 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
H3BN98 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
H3BN98 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
H3BN98 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
H3BN98 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
H3BN98 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
H3BN98 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
H3BN98 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
H3BN98 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
H3BN98 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
H3BN98 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
H3BN98 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
H3BN98 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
H3BN98 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
H3BN98 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
H3BN98 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
H3BN98 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
H3BN98 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
H3BN98 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
H3BN98 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
H3BN98 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
H3BN98 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
H3BN98 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
H3BN98 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
H3BN98 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
H3BN98 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
H3BN98 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
H3BN98 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
H3BN98 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
H3BN98 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
H3BN98 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
H3BN98 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
H3BN98 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
H3BN98 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
H3BN98 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
H3BN98 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
H3BN98 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
H3BN98 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
H3BN98 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
H3BN98 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
H3BN98 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
H3BN98 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
H3BN98 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
H3BN98 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
H3BN98 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
H3BN98 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
H3BN98 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
H3BN98 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
H3BN98 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
H3BN98 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
H3BN98 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
H3BN98 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
H3BN98 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
H3BN98 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
H3BN98 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
H3BN98 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
H3BN98 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
H3BN98 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
H3BN98 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
H3BN98 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
H3BN98 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
H3BN98 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
H3BN98 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
H3BN98 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
H3BN98 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
H3BN98 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
H3BN98 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
H3BN98 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
H3BN98 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
H3BN98 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
H3BN98 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
H3BN98 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
H3BN98 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
H3BN98 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
H3BN98 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
H3BN98 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
H3BN98 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
H3BN98 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
H3BN98 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
H3BN98 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms