Protein–RNA interactions for Protein: B2RXF0

TMEM229A, Transmembrane protein 229A, humanhuman

Predictions only

Length 380 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM229AB2RXF0 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM229AB2RXF0 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM229AB2RXF0 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM229AB2RXF0 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM229AB2RXF0 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM229AB2RXF0 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM229AB2RXF0 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM229AB2RXF0 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM229AB2RXF0 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM229AB2RXF0 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM229AB2RXF0 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM229AB2RXF0 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM229AB2RXF0 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM229AB2RXF0 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM229AB2RXF0 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM229AB2RXF0 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM229AB2RXF0 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM229AB2RXF0 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM229AB2RXF0 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM229AB2RXF0 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM229AB2RXF0 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM229AB2RXF0 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM229AB2RXF0 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM229AB2RXF0 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM229AB2RXF0 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM229AB2RXF0 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM229AB2RXF0 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM229AB2RXF0 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM229AB2RXF0 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM229AB2RXF0 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM229AB2RXF0 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM229AB2RXF0 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM229AB2RXF0 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM229AB2RXF0 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM229AB2RXF0 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM229AB2RXF0 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM229AB2RXF0 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM229AB2RXF0 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM229AB2RXF0 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM229AB2RXF0 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM229AB2RXF0 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM229AB2RXF0 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM229AB2RXF0 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM229AB2RXF0 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM229AB2RXF0 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM229AB2RXF0 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM229AB2RXF0 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM229AB2RXF0 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM229AB2RXF0 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM229AB2RXF0 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM229AB2RXF0 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM229AB2RXF0 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM229AB2RXF0 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM229AB2RXF0 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM229AB2RXF0 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM229AB2RXF0 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM229AB2RXF0 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM229AB2RXF0 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM229AB2RXF0 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM229AB2RXF0 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM229AB2RXF0 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM229AB2RXF0 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM229AB2RXF0 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM229AB2RXF0 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM229AB2RXF0 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM229AB2RXF0 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM229AB2RXF0 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM229AB2RXF0 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM229AB2RXF0 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM229AB2RXF0 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM229AB2RXF0 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM229AB2RXF0 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM229AB2RXF0 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM229AB2RXF0 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM229AB2RXF0 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM229AB2RXF0 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM229AB2RXF0 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM229AB2RXF0 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM229AB2RXF0 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM229AB2RXF0 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM229AB2RXF0 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM229AB2RXF0 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM229AB2RXF0 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM229AB2RXF0 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM229AB2RXF0 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM229AB2RXF0 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM229AB2RXF0 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM229AB2RXF0 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM229AB2RXF0 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM229AB2RXF0 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM229AB2RXF0 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM229AB2RXF0 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM229AB2RXF0 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM229AB2RXF0 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM229AB2RXF0 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM229AB2RXF0 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TMEM229AB2RXF0 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TMEM229AB2RXF0 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TMEM229AB2RXF0 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMEM229AB2RXF0 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms