Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YWF9

TRBV2, T-cell receptor beta variable 2 (Fragment), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV2A0A0J9YWF9 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRBV2A0A0J9YWF9 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRBV2A0A0J9YWF9 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRBV2A0A0J9YWF9 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRBV2A0A0J9YWF9 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRBV2A0A0J9YWF9 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRBV2A0A0J9YWF9 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRBV2A0A0J9YWF9 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRBV2A0A0J9YWF9 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRBV2A0A0J9YWF9 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRBV2A0A0J9YWF9 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRBV2A0A0J9YWF9 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRBV2A0A0J9YWF9 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRBV2A0A0J9YWF9 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRBV2A0A0J9YWF9 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TRBV2A0A0J9YWF9 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRBV2A0A0J9YWF9 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRBV2A0A0J9YWF9 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRBV2A0A0J9YWF9 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRBV2A0A0J9YWF9 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRBV2A0A0J9YWF9 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRBV2A0A0J9YWF9 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRBV2A0A0J9YWF9 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRBV2A0A0J9YWF9 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
TRBV2A0A0J9YWF9 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRBV2A0A0J9YWF9 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRBV2A0A0J9YWF9 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRBV2A0A0J9YWF9 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRBV2A0A0J9YWF9 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRBV2A0A0J9YWF9 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRBV2A0A0J9YWF9 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRBV2A0A0J9YWF9 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRBV2A0A0J9YWF9 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRBV2A0A0J9YWF9 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRBV2A0A0J9YWF9 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRBV2A0A0J9YWF9 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRBV2A0A0J9YWF9 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRBV2A0A0J9YWF9 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRBV2A0A0J9YWF9 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRBV2A0A0J9YWF9 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRBV2A0A0J9YWF9 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRBV2A0A0J9YWF9 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRBV2A0A0J9YWF9 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRBV2A0A0J9YWF9 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRBV2A0A0J9YWF9 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRBV2A0A0J9YWF9 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRBV2A0A0J9YWF9 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRBV2A0A0J9YWF9 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRBV2A0A0J9YWF9 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRBV2A0A0J9YWF9 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRBV2A0A0J9YWF9 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
TRBV2A0A0J9YWF9 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRBV2A0A0J9YWF9 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
TRBV2A0A0J9YWF9 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRBV2A0A0J9YWF9 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRBV2A0A0J9YWF9 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRBV2A0A0J9YWF9 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRBV2A0A0J9YWF9 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRBV2A0A0J9YWF9 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRBV2A0A0J9YWF9 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRBV2A0A0J9YWF9 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRBV2A0A0J9YWF9 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRBV2A0A0J9YWF9 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRBV2A0A0J9YWF9 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRBV2A0A0J9YWF9 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRBV2A0A0J9YWF9 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRBV2A0A0J9YWF9 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRBV2A0A0J9YWF9 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRBV2A0A0J9YWF9 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRBV2A0A0J9YWF9 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRBV2A0A0J9YWF9 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRBV2A0A0J9YWF9 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRBV2A0A0J9YWF9 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRBV2A0A0J9YWF9 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRBV2A0A0J9YWF9 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRBV2A0A0J9YWF9 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRBV2A0A0J9YWF9 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRBV2A0A0J9YWF9 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRBV2A0A0J9YWF9 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRBV2A0A0J9YWF9 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRBV2A0A0J9YWF9 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRBV2A0A0J9YWF9 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRBV2A0A0J9YWF9 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRBV2A0A0J9YWF9 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRBV2A0A0J9YWF9 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRBV2A0A0J9YWF9 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRBV2A0A0J9YWF9 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRBV2A0A0J9YWF9 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRBV2A0A0J9YWF9 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRBV2A0A0J9YWF9 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRBV2A0A0J9YWF9 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRBV2A0A0J9YWF9 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRBV2A0A0J9YWF9 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRBV2A0A0J9YWF9 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRBV2A0A0J9YWF9 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRBV2A0A0J9YWF9 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRBV2A0A0J9YWF9 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRBV2A0A0J9YWF9 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRBV2A0A0J9YWF9 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRBV2A0A0J9YWF9 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
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