Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5T5

USP16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, humanhuman

Predictions only

Length 823 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP16Q9Y5T5 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP16Q9Y5T5 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP16Q9Y5T5 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP16Q9Y5T5 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
USP16Q9Y5T5 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
USP16Q9Y5T5 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP16Q9Y5T5 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP16Q9Y5T5 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP16Q9Y5T5 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
USP16Q9Y5T5 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP16Q9Y5T5 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP16Q9Y5T5 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP16Q9Y5T5 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP16Q9Y5T5 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP16Q9Y5T5 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP16Q9Y5T5 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP16Q9Y5T5 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP16Q9Y5T5 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP16Q9Y5T5 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP16Q9Y5T5 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP16Q9Y5T5 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP16Q9Y5T5 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP16Q9Y5T5 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP16Q9Y5T5 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP16Q9Y5T5 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP16Q9Y5T5 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP16Q9Y5T5 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP16Q9Y5T5 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP16Q9Y5T5 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP16Q9Y5T5 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP16Q9Y5T5 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP16Q9Y5T5 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP16Q9Y5T5 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP16Q9Y5T5 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP16Q9Y5T5 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP16Q9Y5T5 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP16Q9Y5T5 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP16Q9Y5T5 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP16Q9Y5T5 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
USP16Q9Y5T5 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
USP16Q9Y5T5 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP16Q9Y5T5 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP16Q9Y5T5 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
USP16Q9Y5T5 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP16Q9Y5T5 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP16Q9Y5T5 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP16Q9Y5T5 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP16Q9Y5T5 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP16Q9Y5T5 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP16Q9Y5T5 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP16Q9Y5T5 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP16Q9Y5T5 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP16Q9Y5T5 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP16Q9Y5T5 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP16Q9Y5T5 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
USP16Q9Y5T5 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
USP16Q9Y5T5 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP16Q9Y5T5 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP16Q9Y5T5 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP16Q9Y5T5 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP16Q9Y5T5 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP16Q9Y5T5 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP16Q9Y5T5 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP16Q9Y5T5 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP16Q9Y5T5 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP16Q9Y5T5 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP16Q9Y5T5 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP16Q9Y5T5 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP16Q9Y5T5 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
USP16Q9Y5T5 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP16Q9Y5T5 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP16Q9Y5T5 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP16Q9Y5T5 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP16Q9Y5T5 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP16Q9Y5T5 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP16Q9Y5T5 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
USP16Q9Y5T5 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
USP16Q9Y5T5 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP16Q9Y5T5 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP16Q9Y5T5 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP16Q9Y5T5 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP16Q9Y5T5 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP16Q9Y5T5 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP16Q9Y5T5 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP16Q9Y5T5 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP16Q9Y5T5 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP16Q9Y5T5 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP16Q9Y5T5 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP16Q9Y5T5 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP16Q9Y5T5 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP16Q9Y5T5 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP16Q9Y5T5 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP16Q9Y5T5 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP16Q9Y5T5 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
USP16Q9Y5T5 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP16Q9Y5T5 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP16Q9Y5T5 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP16Q9Y5T5 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP16Q9Y5T5 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
USP16Q9Y5T5 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms