Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5K6

CD2AP, CD2-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD2APQ9Y5K6 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CD2APQ9Y5K6 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CD2APQ9Y5K6 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CD2APQ9Y5K6 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CD2APQ9Y5K6 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CD2APQ9Y5K6 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CD2APQ9Y5K6 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CD2APQ9Y5K6 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CD2APQ9Y5K6 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CD2APQ9Y5K6 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CD2APQ9Y5K6 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CD2APQ9Y5K6 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CD2APQ9Y5K6 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CD2APQ9Y5K6 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CD2APQ9Y5K6 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CD2APQ9Y5K6 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CD2APQ9Y5K6 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CD2APQ9Y5K6 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CD2APQ9Y5K6 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CD2APQ9Y5K6 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CD2APQ9Y5K6 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CD2APQ9Y5K6 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CD2APQ9Y5K6 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CD2APQ9Y5K6 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CD2APQ9Y5K6 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CD2APQ9Y5K6 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CD2APQ9Y5K6 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CD2APQ9Y5K6 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CD2APQ9Y5K6 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CD2APQ9Y5K6 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CD2APQ9Y5K6 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CD2APQ9Y5K6 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CD2APQ9Y5K6 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CD2APQ9Y5K6 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CD2APQ9Y5K6 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CD2APQ9Y5K6 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CD2APQ9Y5K6 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CD2APQ9Y5K6 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CD2APQ9Y5K6 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CD2APQ9Y5K6 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CD2APQ9Y5K6 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CD2APQ9Y5K6 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CD2APQ9Y5K6 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CD2APQ9Y5K6 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CD2APQ9Y5K6 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CD2APQ9Y5K6 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CD2APQ9Y5K6 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CD2APQ9Y5K6 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CD2APQ9Y5K6 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CD2APQ9Y5K6 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CD2APQ9Y5K6 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CD2APQ9Y5K6 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CD2APQ9Y5K6 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CD2APQ9Y5K6 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CD2APQ9Y5K6 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CD2APQ9Y5K6 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CD2APQ9Y5K6 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CD2APQ9Y5K6 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CD2APQ9Y5K6 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CD2APQ9Y5K6 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CD2APQ9Y5K6 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CD2APQ9Y5K6 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CD2APQ9Y5K6 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CD2APQ9Y5K6 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CD2APQ9Y5K6 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CD2APQ9Y5K6 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CD2APQ9Y5K6 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CD2APQ9Y5K6 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CD2APQ9Y5K6 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CD2APQ9Y5K6 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CD2APQ9Y5K6 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CD2APQ9Y5K6 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CD2APQ9Y5K6 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CD2APQ9Y5K6 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CD2APQ9Y5K6 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CD2APQ9Y5K6 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CD2APQ9Y5K6 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CD2APQ9Y5K6 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CD2APQ9Y5K6 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CD2APQ9Y5K6 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CD2APQ9Y5K6 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CD2APQ9Y5K6 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CD2APQ9Y5K6 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CD2APQ9Y5K6 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CD2APQ9Y5K6 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CD2APQ9Y5K6 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CD2APQ9Y5K6 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CD2APQ9Y5K6 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CD2APQ9Y5K6 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CD2APQ9Y5K6 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CD2APQ9Y5K6 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CD2APQ9Y5K6 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CD2APQ9Y5K6 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CD2APQ9Y5K6 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CD2APQ9Y5K6 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CD2APQ9Y5K6 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CD2APQ9Y5K6 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CD2APQ9Y5K6 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CD2APQ9Y5K6 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CD2APQ9Y5K6 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms