Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4P1

ATG4B, Cysteine protease ATG4B, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4BQ9Y4P1 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATG4BQ9Y4P1 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATG4BQ9Y4P1 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATG4BQ9Y4P1 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATG4BQ9Y4P1 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATG4BQ9Y4P1 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATG4BQ9Y4P1 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATG4BQ9Y4P1 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATG4BQ9Y4P1 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATG4BQ9Y4P1 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATG4BQ9Y4P1 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATG4BQ9Y4P1 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATG4BQ9Y4P1 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATG4BQ9Y4P1 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATG4BQ9Y4P1 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATG4BQ9Y4P1 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATG4BQ9Y4P1 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATG4BQ9Y4P1 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATG4BQ9Y4P1 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATG4BQ9Y4P1 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATG4BQ9Y4P1 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATG4BQ9Y4P1 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATG4BQ9Y4P1 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATG4BQ9Y4P1 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATG4BQ9Y4P1 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATG4BQ9Y4P1 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
ATG4BQ9Y4P1 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATG4BQ9Y4P1 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATG4BQ9Y4P1 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATG4BQ9Y4P1 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATG4BQ9Y4P1 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATG4BQ9Y4P1 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
ATG4BQ9Y4P1 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATG4BQ9Y4P1 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATG4BQ9Y4P1 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATG4BQ9Y4P1 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATG4BQ9Y4P1 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATG4BQ9Y4P1 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATG4BQ9Y4P1 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATG4BQ9Y4P1 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATG4BQ9Y4P1 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATG4BQ9Y4P1 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATG4BQ9Y4P1 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATG4BQ9Y4P1 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATG4BQ9Y4P1 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATG4BQ9Y4P1 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATG4BQ9Y4P1 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATG4BQ9Y4P1 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATG4BQ9Y4P1 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATG4BQ9Y4P1 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATG4BQ9Y4P1 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATG4BQ9Y4P1 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATG4BQ9Y4P1 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATG4BQ9Y4P1 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATG4BQ9Y4P1 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATG4BQ9Y4P1 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATG4BQ9Y4P1 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATG4BQ9Y4P1 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
ATG4BQ9Y4P1 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATG4BQ9Y4P1 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATG4BQ9Y4P1 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATG4BQ9Y4P1 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATG4BQ9Y4P1 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATG4BQ9Y4P1 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATG4BQ9Y4P1 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATG4BQ9Y4P1 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATG4BQ9Y4P1 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
ATG4BQ9Y4P1 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATG4BQ9Y4P1 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATG4BQ9Y4P1 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATG4BQ9Y4P1 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATG4BQ9Y4P1 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATG4BQ9Y4P1 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATG4BQ9Y4P1 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATG4BQ9Y4P1 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATG4BQ9Y4P1 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATG4BQ9Y4P1 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATG4BQ9Y4P1 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATG4BQ9Y4P1 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATG4BQ9Y4P1 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATG4BQ9Y4P1 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATG4BQ9Y4P1 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATG4BQ9Y4P1 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATG4BQ9Y4P1 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATG4BQ9Y4P1 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATG4BQ9Y4P1 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
ATG4BQ9Y4P1 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATG4BQ9Y4P1 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATG4BQ9Y4P1 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATG4BQ9Y4P1 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATG4BQ9Y4P1 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATG4BQ9Y4P1 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATG4BQ9Y4P1 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATG4BQ9Y4P1 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATG4BQ9Y4P1 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATG4BQ9Y4P1 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
ATG4BQ9Y4P1 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATG4BQ9Y4P1 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
ATG4BQ9Y4P1 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATG4BQ9Y4P1 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms