Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULE6

PALD1, Paladin, humanhuman

Predictions only

Length 856 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALD1Q9ULE6 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PALD1Q9ULE6 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PALD1Q9ULE6 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PALD1Q9ULE6 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PALD1Q9ULE6 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PALD1Q9ULE6 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PALD1Q9ULE6 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PALD1Q9ULE6 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PALD1Q9ULE6 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PALD1Q9ULE6 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PALD1Q9ULE6 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PALD1Q9ULE6 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PALD1Q9ULE6 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PALD1Q9ULE6 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PALD1Q9ULE6 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PALD1Q9ULE6 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PALD1Q9ULE6 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PALD1Q9ULE6 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PALD1Q9ULE6 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PALD1Q9ULE6 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PALD1Q9ULE6 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PALD1Q9ULE6 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PALD1Q9ULE6 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PALD1Q9ULE6 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PALD1Q9ULE6 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PALD1Q9ULE6 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PALD1Q9ULE6 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PALD1Q9ULE6 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PALD1Q9ULE6 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PALD1Q9ULE6 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PALD1Q9ULE6 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PALD1Q9ULE6 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PALD1Q9ULE6 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PALD1Q9ULE6 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PALD1Q9ULE6 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PALD1Q9ULE6 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PALD1Q9ULE6 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PALD1Q9ULE6 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PALD1Q9ULE6 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PALD1Q9ULE6 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PALD1Q9ULE6 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PALD1Q9ULE6 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PALD1Q9ULE6 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PALD1Q9ULE6 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PALD1Q9ULE6 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PALD1Q9ULE6 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PALD1Q9ULE6 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PALD1Q9ULE6 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PALD1Q9ULE6 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PALD1Q9ULE6 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PALD1Q9ULE6 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PALD1Q9ULE6 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PALD1Q9ULE6 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PALD1Q9ULE6 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PALD1Q9ULE6 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PALD1Q9ULE6 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PALD1Q9ULE6 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PALD1Q9ULE6 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PALD1Q9ULE6 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PALD1Q9ULE6 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PALD1Q9ULE6 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PALD1Q9ULE6 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PALD1Q9ULE6 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PALD1Q9ULE6 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PALD1Q9ULE6 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PALD1Q9ULE6 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PALD1Q9ULE6 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PALD1Q9ULE6 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PALD1Q9ULE6 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PALD1Q9ULE6 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PALD1Q9ULE6 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PALD1Q9ULE6 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PALD1Q9ULE6 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PALD1Q9ULE6 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PALD1Q9ULE6 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PALD1Q9ULE6 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PALD1Q9ULE6 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PALD1Q9ULE6 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PALD1Q9ULE6 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PALD1Q9ULE6 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PALD1Q9ULE6 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PALD1Q9ULE6 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PALD1Q9ULE6 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PALD1Q9ULE6 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PALD1Q9ULE6 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PALD1Q9ULE6 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PALD1Q9ULE6 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PALD1Q9ULE6 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PALD1Q9ULE6 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PALD1Q9ULE6 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PALD1Q9ULE6 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PALD1Q9ULE6 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PALD1Q9ULE6 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PALD1Q9ULE6 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PALD1Q9ULE6 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PALD1Q9ULE6 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PALD1Q9ULE6 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PALD1Q9ULE6 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PALD1Q9ULE6 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PALD1Q9ULE6 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms