Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD9

ZNF608, Zinc finger protein 608, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF608Q9ULD9 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ZNF608Q9ULD9 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
ZNF608Q9ULD9 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ZNF608Q9ULD9 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
ZNF608Q9ULD9 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ZNF608Q9ULD9 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
ZNF608Q9ULD9 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
ZNF608Q9ULD9 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
ZNF608Q9ULD9 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
ZNF608Q9ULD9 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
ZNF608Q9ULD9 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
ZNF608Q9ULD9 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
ZNF608Q9ULD9 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
ZNF608Q9ULD9 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
ZNF608Q9ULD9 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
ZNF608Q9ULD9 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
ZNF608Q9ULD9 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
ZNF608Q9ULD9 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.25
ZNF608Q9ULD9 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.25
ZNF608Q9ULD9 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC29.14■■■□□ 2.25
ZNF608Q9ULD9 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
ZNF608Q9ULD9 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
ZNF608Q9ULD9 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
ZNF608Q9ULD9 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
ZNF608Q9ULD9 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
ZNF608Q9ULD9 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
ZNF608Q9ULD9 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ZNF608Q9ULD9 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ZNF608Q9ULD9 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ZNF608Q9ULD9 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ZNF608Q9ULD9 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
ZNF608Q9ULD9 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ZNF608Q9ULD9 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
ZNF608Q9ULD9 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
ZNF608Q9ULD9 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
ZNF608Q9ULD9 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC29.13■■■□□ 2.25
ZNF608Q9ULD9 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
ZNF608Q9ULD9 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
ZNF608Q9ULD9 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
ZNF608Q9ULD9 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ZNF608Q9ULD9 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ZNF608Q9ULD9 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
ZNF608Q9ULD9 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ZNF608Q9ULD9 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ZNF608Q9ULD9 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
ZNF608Q9ULD9 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ZNF608Q9ULD9 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ZNF608Q9ULD9 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
ZNF608Q9ULD9 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC29.12■■■□□ 2.25
ZNF608Q9ULD9 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
ZNF608Q9ULD9 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ZNF608Q9ULD9 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ZNF608Q9ULD9 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ZNF608Q9ULD9 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
ZNF608Q9ULD9 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
ZNF608Q9ULD9 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC29.12■■■□□ 2.25
ZNF608Q9ULD9 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ZNF608Q9ULD9 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
ZNF608Q9ULD9 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC29.12■■■□□ 2.25
ZNF608Q9ULD9 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ZNF608Q9ULD9 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
ZNF608Q9ULD9 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ZNF608Q9ULD9 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
ZNF608Q9ULD9 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
ZNF608Q9ULD9 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ZNF608Q9ULD9 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ZNF608Q9ULD9 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
ZNF608Q9ULD9 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
ZNF608Q9ULD9 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ZNF608Q9ULD9 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
ZNF608Q9ULD9 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
ZNF608Q9ULD9 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
ZNF608Q9ULD9 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
ZNF608Q9ULD9 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
ZNF608Q9ULD9 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
ZNF608Q9ULD9 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ZNF608Q9ULD9 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ZNF608Q9ULD9 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
ZNF608Q9ULD9 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ZNF608Q9ULD9 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
ZNF608Q9ULD9 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ZNF608Q9ULD9 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ZNF608Q9ULD9 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
ZNF608Q9ULD9 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ZNF608Q9ULD9 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ZNF608Q9ULD9 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ZNF608Q9ULD9 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ZNF608Q9ULD9 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
ZNF608Q9ULD9 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ZNF608Q9ULD9 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ZNF608Q9ULD9 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
ZNF608Q9ULD9 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
ZNF608Q9ULD9 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ZNF608Q9ULD9 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ZNF608Q9ULD9 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ZNF608Q9ULD9 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ZNF608Q9ULD9 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ZNF608Q9ULD9 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ZNF608Q9ULD9 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ZNF608Q9ULD9 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms