Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKX5

ITGA11, Integrin alpha-11, humanhuman

Predictions only

Length 1,188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA11Q9UKX5 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ITGA11Q9UKX5 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ITGA11Q9UKX5 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ITGA11Q9UKX5 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ITGA11Q9UKX5 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ITGA11Q9UKX5 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ITGA11Q9UKX5 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ITGA11Q9UKX5 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ITGA11Q9UKX5 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ITGA11Q9UKX5 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ITGA11Q9UKX5 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ITGA11Q9UKX5 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ITGA11Q9UKX5 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ITGA11Q9UKX5 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ITGA11Q9UKX5 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ITGA11Q9UKX5 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ITGA11Q9UKX5 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ITGA11Q9UKX5 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ITGA11Q9UKX5 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ITGA11Q9UKX5 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ITGA11Q9UKX5 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ITGA11Q9UKX5 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ITGA11Q9UKX5 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ITGA11Q9UKX5 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ITGA11Q9UKX5 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ITGA11Q9UKX5 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ITGA11Q9UKX5 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ITGA11Q9UKX5 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ITGA11Q9UKX5 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ITGA11Q9UKX5 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ITGA11Q9UKX5 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ITGA11Q9UKX5 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ITGA11Q9UKX5 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ITGA11Q9UKX5 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ITGA11Q9UKX5 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ITGA11Q9UKX5 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ITGA11Q9UKX5 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ITGA11Q9UKX5 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ITGA11Q9UKX5 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
ITGA11Q9UKX5 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ITGA11Q9UKX5 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ITGA11Q9UKX5 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ITGA11Q9UKX5 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ITGA11Q9UKX5 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ITGA11Q9UKX5 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ITGA11Q9UKX5 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ITGA11Q9UKX5 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ITGA11Q9UKX5 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ITGA11Q9UKX5 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ITGA11Q9UKX5 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ITGA11Q9UKX5 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ITGA11Q9UKX5 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ITGA11Q9UKX5 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ITGA11Q9UKX5 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ITGA11Q9UKX5 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ITGA11Q9UKX5 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ITGA11Q9UKX5 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ITGA11Q9UKX5 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ITGA11Q9UKX5 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ITGA11Q9UKX5 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ITGA11Q9UKX5 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ITGA11Q9UKX5 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ITGA11Q9UKX5 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ITGA11Q9UKX5 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ITGA11Q9UKX5 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ITGA11Q9UKX5 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ITGA11Q9UKX5 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ITGA11Q9UKX5 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ITGA11Q9UKX5 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ITGA11Q9UKX5 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ITGA11Q9UKX5 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGA11Q9UKX5 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGA11Q9UKX5 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGA11Q9UKX5 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGA11Q9UKX5 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGA11Q9UKX5 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGA11Q9UKX5 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGA11Q9UKX5 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGA11Q9UKX5 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGA11Q9UKX5 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGA11Q9UKX5 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGA11Q9UKX5 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGA11Q9UKX5 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGA11Q9UKX5 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGA11Q9UKX5 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGA11Q9UKX5 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGA11Q9UKX5 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGA11Q9UKX5 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGA11Q9UKX5 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGA11Q9UKX5 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGA11Q9UKX5 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGA11Q9UKX5 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGA11Q9UKX5 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGA11Q9UKX5 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGA11Q9UKX5 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGA11Q9UKX5 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ITGA11Q9UKX5 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ITGA11Q9UKX5 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ITGA11Q9UKX5 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ITGA11Q9UKX5 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms