Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIS9

MBD1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD1Q9UIS9 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MBD1Q9UIS9 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MBD1Q9UIS9 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MBD1Q9UIS9 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MBD1Q9UIS9 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
MBD1Q9UIS9 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
MBD1Q9UIS9 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
MBD1Q9UIS9 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
MBD1Q9UIS9 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
MBD1Q9UIS9 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
MBD1Q9UIS9 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MBD1Q9UIS9 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
MBD1Q9UIS9 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
MBD1Q9UIS9 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
MBD1Q9UIS9 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
MBD1Q9UIS9 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
MBD1Q9UIS9 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MBD1Q9UIS9 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MBD1Q9UIS9 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
MBD1Q9UIS9 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MBD1Q9UIS9 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MBD1Q9UIS9 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MBD1Q9UIS9 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
MBD1Q9UIS9 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
MBD1Q9UIS9 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MBD1Q9UIS9 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MBD1Q9UIS9 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MBD1Q9UIS9 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MBD1Q9UIS9 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MBD1Q9UIS9 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MBD1Q9UIS9 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MBD1Q9UIS9 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MBD1Q9UIS9 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MBD1Q9UIS9 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MBD1Q9UIS9 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MBD1Q9UIS9 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
MBD1Q9UIS9 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MBD1Q9UIS9 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
MBD1Q9UIS9 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
MBD1Q9UIS9 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MBD1Q9UIS9 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MBD1Q9UIS9 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
MBD1Q9UIS9 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
MBD1Q9UIS9 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MBD1Q9UIS9 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MBD1Q9UIS9 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MBD1Q9UIS9 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MBD1Q9UIS9 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MBD1Q9UIS9 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MBD1Q9UIS9 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MBD1Q9UIS9 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MBD1Q9UIS9 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MBD1Q9UIS9 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MBD1Q9UIS9 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MBD1Q9UIS9 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MBD1Q9UIS9 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MBD1Q9UIS9 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MBD1Q9UIS9 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MBD1Q9UIS9 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MBD1Q9UIS9 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MBD1Q9UIS9 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MBD1Q9UIS9 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MBD1Q9UIS9 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MBD1Q9UIS9 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MBD1Q9UIS9 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MBD1Q9UIS9 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MBD1Q9UIS9 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MBD1Q9UIS9 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MBD1Q9UIS9 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MBD1Q9UIS9 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MBD1Q9UIS9 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MBD1Q9UIS9 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MBD1Q9UIS9 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MBD1Q9UIS9 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
MBD1Q9UIS9 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MBD1Q9UIS9 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MBD1Q9UIS9 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MBD1Q9UIS9 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MBD1Q9UIS9 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MBD1Q9UIS9 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MBD1Q9UIS9 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
MBD1Q9UIS9 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MBD1Q9UIS9 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MBD1Q9UIS9 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MBD1Q9UIS9 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MBD1Q9UIS9 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MBD1Q9UIS9 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MBD1Q9UIS9 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MBD1Q9UIS9 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MBD1Q9UIS9 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MBD1Q9UIS9 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
MBD1Q9UIS9 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MBD1Q9UIS9 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MBD1Q9UIS9 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MBD1Q9UIS9 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MBD1Q9UIS9 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MBD1Q9UIS9 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MBD1Q9UIS9 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MBD1Q9UIS9 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
MBD1Q9UIS9 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms