Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI33

SCN11A, Sodium channel protein type 11 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN11AQ9UI33 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCN11AQ9UI33 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCN11AQ9UI33 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SCN11AQ9UI33 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCN11AQ9UI33 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SCN11AQ9UI33 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCN11AQ9UI33 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCN11AQ9UI33 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCN11AQ9UI33 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCN11AQ9UI33 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCN11AQ9UI33 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCN11AQ9UI33 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCN11AQ9UI33 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCN11AQ9UI33 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCN11AQ9UI33 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCN11AQ9UI33 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCN11AQ9UI33 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCN11AQ9UI33 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCN11AQ9UI33 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SCN11AQ9UI33 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SCN11AQ9UI33 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SCN11AQ9UI33 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCN11AQ9UI33 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCN11AQ9UI33 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCN11AQ9UI33 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCN11AQ9UI33 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCN11AQ9UI33 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCN11AQ9UI33 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCN11AQ9UI33 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCN11AQ9UI33 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCN11AQ9UI33 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SCN11AQ9UI33 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCN11AQ9UI33 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCN11AQ9UI33 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCN11AQ9UI33 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCN11AQ9UI33 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCN11AQ9UI33 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCN11AQ9UI33 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCN11AQ9UI33 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCN11AQ9UI33 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCN11AQ9UI33 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCN11AQ9UI33 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SCN11AQ9UI33 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCN11AQ9UI33 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCN11AQ9UI33 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCN11AQ9UI33 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCN11AQ9UI33 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCN11AQ9UI33 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCN11AQ9UI33 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCN11AQ9UI33 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCN11AQ9UI33 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCN11AQ9UI33 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCN11AQ9UI33 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCN11AQ9UI33 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCN11AQ9UI33 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCN11AQ9UI33 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCN11AQ9UI33 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCN11AQ9UI33 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCN11AQ9UI33 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCN11AQ9UI33 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SCN11AQ9UI33 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCN11AQ9UI33 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCN11AQ9UI33 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCN11AQ9UI33 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCN11AQ9UI33 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCN11AQ9UI33 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCN11AQ9UI33 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SCN11AQ9UI33 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCN11AQ9UI33 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCN11AQ9UI33 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCN11AQ9UI33 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SCN11AQ9UI33 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SCN11AQ9UI33 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCN11AQ9UI33 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SCN11AQ9UI33 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCN11AQ9UI33 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SCN11AQ9UI33 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCN11AQ9UI33 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCN11AQ9UI33 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCN11AQ9UI33 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCN11AQ9UI33 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SCN11AQ9UI33 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCN11AQ9UI33 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCN11AQ9UI33 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCN11AQ9UI33 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCN11AQ9UI33 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCN11AQ9UI33 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SCN11AQ9UI33 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCN11AQ9UI33 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SCN11AQ9UI33 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SCN11AQ9UI33 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCN11AQ9UI33 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCN11AQ9UI33 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCN11AQ9UI33 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCN11AQ9UI33 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCN11AQ9UI33 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCN11AQ9UI33 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCN11AQ9UI33 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCN11AQ9UI33 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCN11AQ9UI33 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms