Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHA2

SS18L2, SS18-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18L2Q9UHA2 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 TRIO-202ENST00000344204 11100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 SATB2-201ENST00000260926 5318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 AC093668.2-201ENST00000481893 3569 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 AC105052.1-201ENST00000519541 3569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 SYBU-204ENST00000408908 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 IRS1-201ENST00000305123 9705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 DMTN-214ENST00000519907 2658 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 NPFFR1-201ENST00000277942 8921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 SFRP1-202ENST00000379845 3873 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
SS18L2Q9UHA2 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms