Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBE8

NLK, Serine/threonine-protein kinase NLK, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLKQ9UBE8 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NLKQ9UBE8 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NLKQ9UBE8 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NLKQ9UBE8 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NLKQ9UBE8 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NLKQ9UBE8 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NLKQ9UBE8 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NLKQ9UBE8 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NLKQ9UBE8 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NLKQ9UBE8 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NLKQ9UBE8 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NLKQ9UBE8 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NLKQ9UBE8 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NLKQ9UBE8 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
NLKQ9UBE8 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NLKQ9UBE8 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NLKQ9UBE8 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NLKQ9UBE8 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NLKQ9UBE8 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NLKQ9UBE8 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
NLKQ9UBE8 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NLKQ9UBE8 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NLKQ9UBE8 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NLKQ9UBE8 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NLKQ9UBE8 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NLKQ9UBE8 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NLKQ9UBE8 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NLKQ9UBE8 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NLKQ9UBE8 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NLKQ9UBE8 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NLKQ9UBE8 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NLKQ9UBE8 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NLKQ9UBE8 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NLKQ9UBE8 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
NLKQ9UBE8 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NLKQ9UBE8 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NLKQ9UBE8 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NLKQ9UBE8 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NLKQ9UBE8 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NLKQ9UBE8 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NLKQ9UBE8 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NLKQ9UBE8 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NLKQ9UBE8 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
NLKQ9UBE8 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NLKQ9UBE8 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NLKQ9UBE8 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NLKQ9UBE8 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
NLKQ9UBE8 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NLKQ9UBE8 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NLKQ9UBE8 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NLKQ9UBE8 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NLKQ9UBE8 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NLKQ9UBE8 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NLKQ9UBE8 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NLKQ9UBE8 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NLKQ9UBE8 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
NLKQ9UBE8 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NLKQ9UBE8 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NLKQ9UBE8 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NLKQ9UBE8 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NLKQ9UBE8 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
NLKQ9UBE8 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NLKQ9UBE8 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NLKQ9UBE8 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NLKQ9UBE8 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NLKQ9UBE8 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NLKQ9UBE8 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NLKQ9UBE8 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NLKQ9UBE8 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NLKQ9UBE8 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NLKQ9UBE8 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NLKQ9UBE8 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NLKQ9UBE8 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NLKQ9UBE8 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NLKQ9UBE8 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NLKQ9UBE8 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NLKQ9UBE8 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NLKQ9UBE8 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NLKQ9UBE8 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NLKQ9UBE8 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NLKQ9UBE8 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NLKQ9UBE8 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NLKQ9UBE8 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NLKQ9UBE8 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NLKQ9UBE8 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NLKQ9UBE8 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NLKQ9UBE8 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NLKQ9UBE8 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NLKQ9UBE8 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NLKQ9UBE8 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NLKQ9UBE8 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NLKQ9UBE8 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NLKQ9UBE8 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NLKQ9UBE8 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NLKQ9UBE8 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NLKQ9UBE8 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NLKQ9UBE8 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NLKQ9UBE8 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NLKQ9UBE8 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NLKQ9UBE8 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms