Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J3

KLHL9, Kelch-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL9Q9P2J3 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL9Q9P2J3 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL9Q9P2J3 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL9Q9P2J3 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL9Q9P2J3 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL9Q9P2J3 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL9Q9P2J3 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL9Q9P2J3 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL9Q9P2J3 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL9Q9P2J3 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL9Q9P2J3 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL9Q9P2J3 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL9Q9P2J3 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL9Q9P2J3 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL9Q9P2J3 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL9Q9P2J3 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL9Q9P2J3 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL9Q9P2J3 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL9Q9P2J3 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL9Q9P2J3 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL9Q9P2J3 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL9Q9P2J3 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL9Q9P2J3 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL9Q9P2J3 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL9Q9P2J3 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL9Q9P2J3 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL9Q9P2J3 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL9Q9P2J3 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL9Q9P2J3 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL9Q9P2J3 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL9Q9P2J3 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL9Q9P2J3 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL9Q9P2J3 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL9Q9P2J3 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL9Q9P2J3 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL9Q9P2J3 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL9Q9P2J3 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL9Q9P2J3 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL9Q9P2J3 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL9Q9P2J3 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL9Q9P2J3 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL9Q9P2J3 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL9Q9P2J3 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL9Q9P2J3 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL9Q9P2J3 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL9Q9P2J3 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL9Q9P2J3 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL9Q9P2J3 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL9Q9P2J3 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL9Q9P2J3 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL9Q9P2J3 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL9Q9P2J3 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL9Q9P2J3 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL9Q9P2J3 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL9Q9P2J3 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL9Q9P2J3 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL9Q9P2J3 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL9Q9P2J3 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL9Q9P2J3 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL9Q9P2J3 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL9Q9P2J3 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL9Q9P2J3 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL9Q9P2J3 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL9Q9P2J3 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL9Q9P2J3 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL9Q9P2J3 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL9Q9P2J3 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL9Q9P2J3 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL9Q9P2J3 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL9Q9P2J3 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL9Q9P2J3 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL9Q9P2J3 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL9Q9P2J3 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL9Q9P2J3 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL9Q9P2J3 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL9Q9P2J3 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL9Q9P2J3 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL9Q9P2J3 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL9Q9P2J3 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL9Q9P2J3 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL9Q9P2J3 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL9Q9P2J3 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL9Q9P2J3 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL9Q9P2J3 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL9Q9P2J3 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL9Q9P2J3 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL9Q9P2J3 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL9Q9P2J3 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL9Q9P2J3 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL9Q9P2J3 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL9Q9P2J3 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL9Q9P2J3 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL9Q9P2J3 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
KLHL9Q9P2J3 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
KLHL9Q9P2J3 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
KLHL9Q9P2J3 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL9Q9P2J3 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL9Q9P2J3 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL9Q9P2J3 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KLHL9Q9P2J3 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms