Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E5

CHPF2, Chondroitin sulfate glucuronyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHPF2Q9P2E5 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHPF2Q9P2E5 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHPF2Q9P2E5 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CHPF2Q9P2E5 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CHPF2Q9P2E5 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHPF2Q9P2E5 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHPF2Q9P2E5 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHPF2Q9P2E5 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHPF2Q9P2E5 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHPF2Q9P2E5 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHPF2Q9P2E5 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHPF2Q9P2E5 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHPF2Q9P2E5 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHPF2Q9P2E5 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHPF2Q9P2E5 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHPF2Q9P2E5 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHPF2Q9P2E5 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHPF2Q9P2E5 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHPF2Q9P2E5 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHPF2Q9P2E5 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHPF2Q9P2E5 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHPF2Q9P2E5 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHPF2Q9P2E5 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHPF2Q9P2E5 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHPF2Q9P2E5 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CHPF2Q9P2E5 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHPF2Q9P2E5 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHPF2Q9P2E5 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHPF2Q9P2E5 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHPF2Q9P2E5 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHPF2Q9P2E5 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHPF2Q9P2E5 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHPF2Q9P2E5 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHPF2Q9P2E5 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHPF2Q9P2E5 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHPF2Q9P2E5 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHPF2Q9P2E5 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CHPF2Q9P2E5 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHPF2Q9P2E5 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHPF2Q9P2E5 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHPF2Q9P2E5 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHPF2Q9P2E5 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHPF2Q9P2E5 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHPF2Q9P2E5 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHPF2Q9P2E5 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHPF2Q9P2E5 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHPF2Q9P2E5 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHPF2Q9P2E5 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHPF2Q9P2E5 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHPF2Q9P2E5 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHPF2Q9P2E5 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHPF2Q9P2E5 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHPF2Q9P2E5 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHPF2Q9P2E5 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHPF2Q9P2E5 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CHPF2Q9P2E5 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHPF2Q9P2E5 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHPF2Q9P2E5 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHPF2Q9P2E5 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHPF2Q9P2E5 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CHPF2Q9P2E5 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHPF2Q9P2E5 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHPF2Q9P2E5 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHPF2Q9P2E5 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHPF2Q9P2E5 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHPF2Q9P2E5 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHPF2Q9P2E5 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHPF2Q9P2E5 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHPF2Q9P2E5 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHPF2Q9P2E5 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHPF2Q9P2E5 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHPF2Q9P2E5 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHPF2Q9P2E5 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHPF2Q9P2E5 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHPF2Q9P2E5 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHPF2Q9P2E5 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CHPF2Q9P2E5 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHPF2Q9P2E5 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHPF2Q9P2E5 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHPF2Q9P2E5 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHPF2Q9P2E5 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CHPF2Q9P2E5 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHPF2Q9P2E5 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHPF2Q9P2E5 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHPF2Q9P2E5 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHPF2Q9P2E5 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHPF2Q9P2E5 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHPF2Q9P2E5 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHPF2Q9P2E5 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHPF2Q9P2E5 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CHPF2Q9P2E5 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHPF2Q9P2E5 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CHPF2Q9P2E5 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHPF2Q9P2E5 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHPF2Q9P2E5 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CHPF2Q9P2E5 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHPF2Q9P2E5 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHPF2Q9P2E5 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHPF2Q9P2E5 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHPF2Q9P2E5 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms