Protein–RNA interactions for Protein: Q9P267

MBD5, Methyl-CpG-binding domain protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD5Q9P267 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
MBD5Q9P267 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
MBD5Q9P267 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
MBD5Q9P267 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
MBD5Q9P267 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
MBD5Q9P267 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
MBD5Q9P267 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
MBD5Q9P267 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
MBD5Q9P267 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
MBD5Q9P267 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
MBD5Q9P267 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
MBD5Q9P267 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
MBD5Q9P267 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
MBD5Q9P267 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC26.46■■□□□ 1.83
MBD5Q9P267 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.46■■□□□ 1.83
MBD5Q9P267 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
MBD5Q9P267 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
MBD5Q9P267 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
MBD5Q9P267 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
MBD5Q9P267 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
MBD5Q9P267 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
MBD5Q9P267 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
MBD5Q9P267 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
MBD5Q9P267 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
MBD5Q9P267 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
MBD5Q9P267 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
MBD5Q9P267 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
MBD5Q9P267 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
MBD5Q9P267 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
MBD5Q9P267 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
MBD5Q9P267 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
MBD5Q9P267 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
MBD5Q9P267 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
MBD5Q9P267 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
MBD5Q9P267 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
MBD5Q9P267 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
MBD5Q9P267 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MBD5Q9P267 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
MBD5Q9P267 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MBD5Q9P267 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MBD5Q9P267 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MBD5Q9P267 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MBD5Q9P267 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MBD5Q9P267 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MBD5Q9P267 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
MBD5Q9P267 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MBD5Q9P267 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
MBD5Q9P267 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
MBD5Q9P267 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
MBD5Q9P267 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MBD5Q9P267 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
MBD5Q9P267 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
MBD5Q9P267 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
MBD5Q9P267 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
MBD5Q9P267 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MBD5Q9P267 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MBD5Q9P267 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MBD5Q9P267 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
MBD5Q9P267 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
MBD5Q9P267 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
MBD5Q9P267 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
MBD5Q9P267 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
MBD5Q9P267 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
MBD5Q9P267 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
MBD5Q9P267 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
MBD5Q9P267 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
MBD5Q9P267 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
MBD5Q9P267 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
MBD5Q9P267 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
MBD5Q9P267 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
MBD5Q9P267 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
MBD5Q9P267 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
MBD5Q9P267 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
MBD5Q9P267 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
MBD5Q9P267 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
MBD5Q9P267 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
MBD5Q9P267 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
MBD5Q9P267 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
MBD5Q9P267 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
MBD5Q9P267 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
MBD5Q9P267 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
MBD5Q9P267 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
MBD5Q9P267 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
MBD5Q9P267 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
MBD5Q9P267 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
MBD5Q9P267 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
MBD5Q9P267 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
MBD5Q9P267 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
MBD5Q9P267 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
MBD5Q9P267 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
MBD5Q9P267 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
MBD5Q9P267 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
MBD5Q9P267 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
MBD5Q9P267 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
MBD5Q9P267 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
MBD5Q9P267 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
MBD5Q9P267 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
MBD5Q9P267 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
MBD5Q9P267 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
MBD5Q9P267 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms