Protein–RNA interactions for Protein: Q9P219

CCDC88C, Protein Daple, humanhuman

Predictions only

Length 2,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC88CQ9P219 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC88CQ9P219 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC88CQ9P219 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC88CQ9P219 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC88CQ9P219 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC88CQ9P219 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC88CQ9P219 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC88CQ9P219 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC88CQ9P219 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC88CQ9P219 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC88CQ9P219 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC88CQ9P219 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC88CQ9P219 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC88CQ9P219 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC88CQ9P219 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC88CQ9P219 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC88CQ9P219 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC88CQ9P219 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC88CQ9P219 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC88CQ9P219 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC88CQ9P219 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC88CQ9P219 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC88CQ9P219 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC88CQ9P219 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC88CQ9P219 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC88CQ9P219 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC88CQ9P219 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC88CQ9P219 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC88CQ9P219 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC88CQ9P219 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC88CQ9P219 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC88CQ9P219 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC88CQ9P219 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC88CQ9P219 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC88CQ9P219 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC88CQ9P219 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC88CQ9P219 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC88CQ9P219 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC88CQ9P219 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC88CQ9P219 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC88CQ9P219 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC88CQ9P219 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC88CQ9P219 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC88CQ9P219 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC88CQ9P219 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC88CQ9P219 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC88CQ9P219 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC88CQ9P219 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC88CQ9P219 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC88CQ9P219 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC88CQ9P219 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC88CQ9P219 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC88CQ9P219 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC88CQ9P219 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC88CQ9P219 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC88CQ9P219 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC88CQ9P219 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC88CQ9P219 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC88CQ9P219 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC88CQ9P219 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC88CQ9P219 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC88CQ9P219 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC88CQ9P219 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC88CQ9P219 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC88CQ9P219 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC88CQ9P219 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC88CQ9P219 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC88CQ9P219 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC88CQ9P219 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC88CQ9P219 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC88CQ9P219 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC88CQ9P219 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC88CQ9P219 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC88CQ9P219 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC88CQ9P219 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC88CQ9P219 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC88CQ9P219 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC88CQ9P219 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC88CQ9P219 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC88CQ9P219 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC88CQ9P219 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC88CQ9P219 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC88CQ9P219 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC88CQ9P219 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC88CQ9P219 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC88CQ9P219 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC88CQ9P219 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC88CQ9P219 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC88CQ9P219 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC88CQ9P219 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC88CQ9P219 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC88CQ9P219 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC88CQ9P219 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC88CQ9P219 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC88CQ9P219 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC88CQ9P219 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC88CQ9P219 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC88CQ9P219 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC88CQ9P219 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC88CQ9P219 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms