Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXS3

KLHL28, Kelch-like protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL28Q9NXS3 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL28Q9NXS3 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL28Q9NXS3 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL28Q9NXS3 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL28Q9NXS3 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL28Q9NXS3 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL28Q9NXS3 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL28Q9NXS3 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL28Q9NXS3 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL28Q9NXS3 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL28Q9NXS3 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL28Q9NXS3 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL28Q9NXS3 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL28Q9NXS3 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL28Q9NXS3 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL28Q9NXS3 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL28Q9NXS3 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL28Q9NXS3 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHL28Q9NXS3 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL28Q9NXS3 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL28Q9NXS3 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL28Q9NXS3 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL28Q9NXS3 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL28Q9NXS3 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL28Q9NXS3 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL28Q9NXS3 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL28Q9NXS3 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL28Q9NXS3 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL28Q9NXS3 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL28Q9NXS3 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL28Q9NXS3 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL28Q9NXS3 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL28Q9NXS3 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL28Q9NXS3 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL28Q9NXS3 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL28Q9NXS3 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL28Q9NXS3 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL28Q9NXS3 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL28Q9NXS3 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL28Q9NXS3 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL28Q9NXS3 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL28Q9NXS3 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL28Q9NXS3 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL28Q9NXS3 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL28Q9NXS3 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL28Q9NXS3 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL28Q9NXS3 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL28Q9NXS3 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL28Q9NXS3 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL28Q9NXS3 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL28Q9NXS3 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL28Q9NXS3 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL28Q9NXS3 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL28Q9NXS3 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL28Q9NXS3 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL28Q9NXS3 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL28Q9NXS3 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL28Q9NXS3 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL28Q9NXS3 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL28Q9NXS3 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL28Q9NXS3 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLHL28Q9NXS3 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLHL28Q9NXS3 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLHL28Q9NXS3 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLHL28Q9NXS3 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLHL28Q9NXS3 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLHL28Q9NXS3 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLHL28Q9NXS3 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLHL28Q9NXS3 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLHL28Q9NXS3 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLHL28Q9NXS3 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLHL28Q9NXS3 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLHL28Q9NXS3 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLHL28Q9NXS3 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLHL28Q9NXS3 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLHL28Q9NXS3 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
KLHL28Q9NXS3 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLHL28Q9NXS3 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLHL28Q9NXS3 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLHL28Q9NXS3 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLHL28Q9NXS3 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLHL28Q9NXS3 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLHL28Q9NXS3 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLHL28Q9NXS3 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
KLHL28Q9NXS3 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLHL28Q9NXS3 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLHL28Q9NXS3 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLHL28Q9NXS3 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLHL28Q9NXS3 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLHL28Q9NXS3 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLHL28Q9NXS3 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLHL28Q9NXS3 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLHL28Q9NXS3 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLHL28Q9NXS3 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KLHL28Q9NXS3 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KLHL28Q9NXS3 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KLHL28Q9NXS3 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KLHL28Q9NXS3 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KLHL28Q9NXS3 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KLHL28Q9NXS3 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70 ms