Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXJ0

MS4A12, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 12, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A12Q9NXJ0 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MS4A12Q9NXJ0 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MS4A12Q9NXJ0 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MS4A12Q9NXJ0 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MS4A12Q9NXJ0 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MS4A12Q9NXJ0 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MS4A12Q9NXJ0 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MS4A12Q9NXJ0 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MS4A12Q9NXJ0 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MS4A12Q9NXJ0 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MS4A12Q9NXJ0 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MS4A12Q9NXJ0 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
MS4A12Q9NXJ0 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
MS4A12Q9NXJ0 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MS4A12Q9NXJ0 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
MS4A12Q9NXJ0 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC17■□□□□ 0.31
MS4A12Q9NXJ0 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
MS4A12Q9NXJ0 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
MS4A12Q9NXJ0 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MS4A12Q9NXJ0 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MS4A12Q9NXJ0 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MS4A12Q9NXJ0 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MS4A12Q9NXJ0 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MS4A12Q9NXJ0 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MS4A12Q9NXJ0 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MS4A12Q9NXJ0 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MS4A12Q9NXJ0 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MS4A12Q9NXJ0 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MS4A12Q9NXJ0 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MS4A12Q9NXJ0 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MS4A12Q9NXJ0 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MS4A12Q9NXJ0 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
MS4A12Q9NXJ0 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
MS4A12Q9NXJ0 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MS4A12Q9NXJ0 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MS4A12Q9NXJ0 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC17■□□□□ 0.31
MS4A12Q9NXJ0 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
MS4A12Q9NXJ0 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
MS4A12Q9NXJ0 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
MS4A12Q9NXJ0 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC17■□□□□ 0.31
MS4A12Q9NXJ0 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC17■□□□□ 0.31
MS4A12Q9NXJ0 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC17■□□□□ 0.31
MS4A12Q9NXJ0 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC17■□□□□ 0.31
MS4A12Q9NXJ0 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MS4A12Q9NXJ0 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
MS4A12Q9NXJ0 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
MS4A12Q9NXJ0 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC17■□□□□ 0.31
MS4A12Q9NXJ0 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
MS4A12Q9NXJ0 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC17■□□□□ 0.31
MS4A12Q9NXJ0 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
MS4A12Q9NXJ0 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MS4A12Q9NXJ0 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
MS4A12Q9NXJ0 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MS4A12Q9NXJ0 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MS4A12Q9NXJ0 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MS4A12Q9NXJ0 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MS4A12Q9NXJ0 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
MS4A12Q9NXJ0 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
MS4A12Q9NXJ0 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MS4A12Q9NXJ0 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MS4A12Q9NXJ0 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MS4A12Q9NXJ0 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MS4A12Q9NXJ0 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MS4A12Q9NXJ0 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MS4A12Q9NXJ0 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MS4A12Q9NXJ0 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MS4A12Q9NXJ0 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MS4A12Q9NXJ0 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MS4A12Q9NXJ0 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MS4A12Q9NXJ0 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MS4A12Q9NXJ0 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MS4A12Q9NXJ0 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MS4A12Q9NXJ0 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MS4A12Q9NXJ0 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MS4A12Q9NXJ0 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
MS4A12Q9NXJ0 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MS4A12Q9NXJ0 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MS4A12Q9NXJ0 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MS4A12Q9NXJ0 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MS4A12Q9NXJ0 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MS4A12Q9NXJ0 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MS4A12Q9NXJ0 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MS4A12Q9NXJ0 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MS4A12Q9NXJ0 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MS4A12Q9NXJ0 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MS4A12Q9NXJ0 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MS4A12Q9NXJ0 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MS4A12Q9NXJ0 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MS4A12Q9NXJ0 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MS4A12Q9NXJ0 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MS4A12Q9NXJ0 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MS4A12Q9NXJ0 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MS4A12Q9NXJ0 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MS4A12Q9NXJ0 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MS4A12Q9NXJ0 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MS4A12Q9NXJ0 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MS4A12Q9NXJ0 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MS4A12Q9NXJ0 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MS4A12Q9NXJ0 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MS4A12Q9NXJ0 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.7 ms