Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVI7

ATAD3A, ATPase family AAA domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD3AQ9NVI7 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATAD3AQ9NVI7 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATAD3AQ9NVI7 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATAD3AQ9NVI7 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATAD3AQ9NVI7 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATAD3AQ9NVI7 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ATAD3AQ9NVI7 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATAD3AQ9NVI7 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATAD3AQ9NVI7 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATAD3AQ9NVI7 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATAD3AQ9NVI7 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATAD3AQ9NVI7 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATAD3AQ9NVI7 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATAD3AQ9NVI7 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATAD3AQ9NVI7 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATAD3AQ9NVI7 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATAD3AQ9NVI7 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATAD3AQ9NVI7 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATAD3AQ9NVI7 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATAD3AQ9NVI7 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATAD3AQ9NVI7 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATAD3AQ9NVI7 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATAD3AQ9NVI7 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATAD3AQ9NVI7 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATAD3AQ9NVI7 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATAD3AQ9NVI7 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATAD3AQ9NVI7 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATAD3AQ9NVI7 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATAD3AQ9NVI7 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATAD3AQ9NVI7 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATAD3AQ9NVI7 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATAD3AQ9NVI7 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATAD3AQ9NVI7 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATAD3AQ9NVI7 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATAD3AQ9NVI7 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATAD3AQ9NVI7 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATAD3AQ9NVI7 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATAD3AQ9NVI7 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATAD3AQ9NVI7 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATAD3AQ9NVI7 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATAD3AQ9NVI7 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATAD3AQ9NVI7 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATAD3AQ9NVI7 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATAD3AQ9NVI7 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATAD3AQ9NVI7 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ATAD3AQ9NVI7 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATAD3AQ9NVI7 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATAD3AQ9NVI7 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATAD3AQ9NVI7 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATAD3AQ9NVI7 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATAD3AQ9NVI7 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATAD3AQ9NVI7 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATAD3AQ9NVI7 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATAD3AQ9NVI7 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATAD3AQ9NVI7 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATAD3AQ9NVI7 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATAD3AQ9NVI7 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATAD3AQ9NVI7 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATAD3AQ9NVI7 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATAD3AQ9NVI7 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATAD3AQ9NVI7 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATAD3AQ9NVI7 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATAD3AQ9NVI7 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATAD3AQ9NVI7 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATAD3AQ9NVI7 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATAD3AQ9NVI7 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATAD3AQ9NVI7 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATAD3AQ9NVI7 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATAD3AQ9NVI7 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATAD3AQ9NVI7 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATAD3AQ9NVI7 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATAD3AQ9NVI7 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATAD3AQ9NVI7 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATAD3AQ9NVI7 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATAD3AQ9NVI7 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATAD3AQ9NVI7 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATAD3AQ9NVI7 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATAD3AQ9NVI7 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATAD3AQ9NVI7 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATAD3AQ9NVI7 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATAD3AQ9NVI7 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATAD3AQ9NVI7 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATAD3AQ9NVI7 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATAD3AQ9NVI7 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATAD3AQ9NVI7 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATAD3AQ9NVI7 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATAD3AQ9NVI7 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATAD3AQ9NVI7 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATAD3AQ9NVI7 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATAD3AQ9NVI7 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATAD3AQ9NVI7 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATAD3AQ9NVI7 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATAD3AQ9NVI7 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATAD3AQ9NVI7 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATAD3AQ9NVI7 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATAD3AQ9NVI7 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATAD3AQ9NVI7 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATAD3AQ9NVI7 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATAD3AQ9NVI7 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATAD3AQ9NVI7 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms